79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4212 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  100 
 
 
789 aa  1538    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  41.07 
 
 
787 aa  538  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  39.92 
 
 
787 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  37.63 
 
 
787 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  40.26 
 
 
787 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  39.16 
 
 
787 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  40.05 
 
 
793 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  36.61 
 
 
787 aa  473  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  39.03 
 
 
787 aa  475  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  39.52 
 
 
787 aa  474  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  36.61 
 
 
787 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  36.48 
 
 
789 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  37.02 
 
 
789 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  36.48 
 
 
789 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  33.67 
 
 
788 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  36.94 
 
 
787 aa  465  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  38.52 
 
 
787 aa  456  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  37.83 
 
 
786 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  38.97 
 
 
788 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  35.71 
 
 
787 aa  452  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  38.46 
 
 
789 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  38.53 
 
 
789 aa  442  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  37.76 
 
 
787 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  39.87 
 
 
786 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  36.94 
 
 
788 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  36.62 
 
 
800 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  39.41 
 
 
786 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  34.97 
 
 
788 aa  432  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  35.61 
 
 
791 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  38.9 
 
 
786 aa  426  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  38.07 
 
 
790 aa  423  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  38.23 
 
 
788 aa  422  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  37.63 
 
 
793 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  36.51 
 
 
787 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  38.46 
 
 
790 aa  395  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  35.58 
 
 
793 aa  386  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  37.92 
 
 
786 aa  360  7e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  27.96 
 
 
791 aa  312  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  28.72 
 
 
792 aa  301  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 
792 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  27.14 
 
 
792 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  26.24 
 
 
797 aa  253  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  28.11 
 
 
787 aa  217  7e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  23.08 
 
 
774 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  22.12 
 
 
1132 aa  135  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  21.29 
 
 
1132 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  24.91 
 
 
1090 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  20.95 
 
 
859 aa  119  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  21.61 
 
 
737 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  21.94 
 
 
1016 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  21.59 
 
 
947 aa  113  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  25.13 
 
 
1177 aa  104  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  19.92 
 
 
743 aa  103  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  20.16 
 
 
868 aa  94.7  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  18.7 
 
 
773 aa  93.2  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  21.47 
 
 
876 aa  92.4  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  23.01 
 
 
1143 aa  89  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  15.47 
 
 
1068 aa  75.9  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  22.92 
 
 
1110 aa  75.1  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  22.68 
 
 
1232 aa  72.8  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  22.14 
 
 
917 aa  71.2  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  21.96 
 
 
749 aa  67  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  21.33 
 
 
1211 aa  65.5  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  24.16 
 
 
806 aa  62.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.77 
 
 
855 aa  57  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4337  hypothetical protein  26.05 
 
 
876 aa  54.7  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412663  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.42 
 
 
416 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  20.02 
 
 
759 aa  51.2  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.19 
 
 
416 aa  49.7  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2729  protein of unknown function DUF214  27.65 
 
 
796 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  24.55 
 
 
399 aa  48.5  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  22.76 
 
 
389 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0018  hypothetical protein  32.22 
 
 
1797 aa  46.2  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  23.55 
 
 
830 aa  44.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf117  ABC transporter permease protein  21.62 
 
 
2777 aa  44.7  0.007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.247181  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.02 
 
 
414 aa  44.3  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  23.1 
 
 
821 aa  44.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 
803 aa  44.3  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01820  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.57 
 
 
811 aa  44.3  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>