More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3300 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3300  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  249  9.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.420279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2047  response regulator receiver protein  64.29 
 
 		 127 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000802297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0768  response regulator receiver protein  64.23 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4605  response regulator receiver domain-containing protein  54.33 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2284  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1889  response regulator receiver domain-containing protein  40.74 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3910  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.867729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3355  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.61 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.687232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  36.36 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1977  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 265 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0224  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 379 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3739  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 379 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  36.7 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 346 aa  61.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2021  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1082 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2224  putative two-component regulatory system, sensor kinase protein  37.61 
 
 		 1082 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1771  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 613 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228361 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2077  sensor histidine kinase/response regulator  37.61 
 
 		 1082 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.981024  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3347  DNA-binding transcriptional regulator TorR  36.45 
 
 		 236 aa  60.5  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000384276  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  34.96 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.71 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  34.96 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.94 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  35.77 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  35.79 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  34.96 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  34.96 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5488  two-component response regulator AlgR  38.14 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  34.96 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3976  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 500 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.833176 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  36.11 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 1064 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4667  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.07 
 
 		 495 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2675  sensor histidine kinase/response regulator  40.18 
 
 		 651 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2874  response regulator receiver  33.63 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0625  two component LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793996  hitchhiker  0.00440064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3668  two-component response regulator AlgR  38.6 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00827536  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1990  DNA-binding transcriptional regulator TorR  35.51 
 
 		 241 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697946  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.7 
 
 		 711 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  34.26 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0149  sensor histidine kinase/response regulator  32.38 
 
 		 371 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0063  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  37.5 
 
 		 248 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 235 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2984  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.08 
 
 		 458 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.826768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0279  two-component response regulator AlgR  38.39 
 
 		 248 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  36.19 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0474  sensor histidine kinase/response regulator  39.29 
 
 		 639 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1639  response regulator/sensor histidine kinase  39.29 
 
 		 693 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0878  sensor histidine kinase/response regulator  39.29 
 
 		 654 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4333  nitrogen regulation protein NR(I)  33.33 
 
 		 469 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0992  helix-turn-helix, Fis-type  33.33 
 
 		 498 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1795  sensor histidine kinase/response regulator  39.29 
 
 		 654 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2407  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 577 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03164  hypothetical protein  31.9 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4237  nitrogen regulation protein NR(I)  33.33 
 
 		 469 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4394  nitrogen regulation protein NR(I)  33.33 
 
 		 469 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  35.85 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4287  nitrogen regulation protein NR(I)  33.33 
 
 		 469 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0756679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3207  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1070  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 575 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.677044  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1617  Signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 644 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2095  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 567 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1879  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 567 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4216  nitrogen regulation protein NR(I)  33.33 
 
 		 469 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.295301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3531  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0684  sensor histidine kinase/response regulator  39.29 
 
 		 654 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1402  sensor histidine kinase/response regulator  39.29 
 
 		 654 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  36.45 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.13 
 
 		 957 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  30.61 
 
 		 837 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 1237 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473456  normal  0.0283242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1828  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 		 379 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6007  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  36.61 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2842  response regulator receiver domain-containing protein  36.84 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.810937  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2738  response regulator receiver domain-containing protein  33.94 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000186206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2329  response regulator receiver  26.09 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.25746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1047  DNA-binding transcriptional regulator TorR  33.64 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.499715  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1112  DNA-binding transcriptional regulator TorR  33.64 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1663  two component LuxR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0154836  unclonable  0.0000152825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69470  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  36.61 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.184834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3367  DNA-binding transcriptional regulator TorR  35.19 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1051  DNA-binding transcriptional regulator TorR  33.64 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.44318 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1732  two component LuxR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0049943  normal  0.183248 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2550  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 685 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1228  DNA-binding transcriptional regulator TorR  33.64 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.5 
 
 		 333 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0762  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 		 368 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.218112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1911  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 787 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0413731  normal  0.503462 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  26.67 
 
 		 822 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  33.64 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>