More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1402 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1617  Signal transduction histidine kinase  96.89 
 
 
644 aa  1144    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0878  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 
654 aa  1279    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1795  sensor histidine kinase/response regulator  99.54 
 
 
654 aa  1270    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2675  sensor histidine kinase/response regulator  89.14 
 
 
651 aa  1085    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0474  sensor histidine kinase/response regulator  99.84 
 
 
639 aa  1243    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0684  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 
654 aa  1279    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1402  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 
654 aa  1279    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1639  response regulator/sensor histidine kinase  99.54 
 
 
693 aa  1269    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4255  PAS/PAC sensor, hybrid histidine kinase  40.06 
 
 
1418 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377123  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 
1436 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4605  histidine protein kinase  38.76 
 
 
1309 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.292459  normal  0.0589738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 
1436 aa  308  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3079  composite two component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  38.04 
 
 
994 aa  300  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0449118  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.78 
 
 
1194 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0814409  normal  0.0127622 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0358  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 
1485 aa  266  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4067  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
1490 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0633  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
1480 aa  265  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461456  normal  0.141694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
1237 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473456  normal  0.0283242 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0288  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 
1141 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4445  response regulator/sensor histidine kinase  29.91 
 
 
1141 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 
833 aa  233  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.06 
 
 
948 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2798  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.6 
 
 
949 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000245809  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0290  histidine kinase  28.92 
 
 
931 aa  229  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000039083 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3210  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.54 
 
 
951 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.65 
 
 
934 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 
1316 aa  226  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.93 
 
 
949 aa  226  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2359  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.93 
 
 
949 aa  226  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000333746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.93 
 
 
949 aa  226  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02145  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.93 
 
 
933 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02104  hypothetical protein  31.93 
 
 
933 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2367  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.93 
 
 
949 aa  225  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000101959  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  33.2 
 
 
1122 aa  225  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  31.93 
 
 
949 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3358  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.93 
 
 
949 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00504503  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0720  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.93 
 
 
949 aa  224  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00107574  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1106  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.13 
 
 
951 aa  223  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615004  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0139  histidine kinase  29.22 
 
 
1064 aa  223  9e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  31.82 
 
 
1014 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  29.34 
 
 
765 aa  222  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 
993 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5724  two-component regulatory system sensory histidine kinase  35.1 
 
 
784 aa  220  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.33 
 
 
955 aa  219  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.5 
 
 
927 aa  216  8e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2497  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.53 
 
 
948 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147984  normal  0.803827 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2844  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.18 
 
 
957 aa  216  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.436473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2765  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.18 
 
 
949 aa  216  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.18 
 
 
949 aa  216  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
929 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  33.14 
 
 
727 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2511  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.34 
 
 
948 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0476144 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2456  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.34 
 
 
948 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290959  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3078  histidine kinase  35.06 
 
 
774 aa  215  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.398115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2407  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.74 
 
 
948 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000239257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3015  kinase sensor protein  33.4 
 
 
936 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2615  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.74 
 
 
915 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.544475 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
925 aa  214  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  29 
 
 
1240 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.02 
 
 
1331 aa  214  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 
1768 aa  212  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 
1363 aa  213  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  34.62 
 
 
772 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.54 
 
 
1499 aa  212  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 
950 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 
925 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
1042 aa  211  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 
745 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  30.49 
 
 
1322 aa  211  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  28.85 
 
 
891 aa  209  9e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 
1040 aa  209  9e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  33.07 
 
 
1177 aa  209  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  28.41 
 
 
1765 aa  209  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000544  hypothetical protein  30.36 
 
 
828 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 
1033 aa  209  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59800  kinase sensor protein  33.67 
 
 
931 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000197458  hitchhiker  2.65975e-17 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 
1398 aa  209  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4509  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 
1022 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0775662 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.28 
 
 
918 aa  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 
816 aa  209  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  29.08 
 
 
932 aa  209  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  32.95 
 
 
1255 aa  208  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0987  histidine kinase  28.1 
 
 
938 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718308  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  30.97 
 
 
923 aa  207  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  31.41 
 
 
1407 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  32.12 
 
 
785 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0909  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.29 
 
 
1333 aa  207  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257325  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.22 
 
 
957 aa  207  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  32.12 
 
 
785 aa  207  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 
1054 aa  206  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.27 
 
 
1109 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 
1255 aa  206  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 
909 aa  206  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2818  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.42 
 
 
720 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  30.77 
 
 
925 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  30.65 
 
 
852 aa  204  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
1240 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3839  histidine kinase  33.53 
 
 
590 aa  204  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1911  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
787 aa  204  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0413731  normal  0.503462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3749  histidine kinase  33.19 
 
 
935 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>