285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3161 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  68.69 
 
 		 220 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  70.33 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  69.72 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  71.5 
 
 		 216 aa  298  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  65.3 
 
 		 267 aa  295  6e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  65.3 
 
 		 267 aa  294  8e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  67.27 
 
 		 239 aa  294  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  64.57 
 
 		 243 aa  288  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  67.91 
 
 		 218 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  64.22 
 
 		 270 aa  284  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  66.99 
 
 		 236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  64.98 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  66.98 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 225 aa  281  8.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  65.12 
 
 		 218 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  65.12 
 
 		 218 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  62.87 
 
 		 244 aa  279  4e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  64.59 
 
 		 216 aa  277  9e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  59.09 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  64.55 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  65.28 
 
 		 244 aa  274  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  65.91 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  66.81 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  59.31 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  64.55 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  59.74 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  69.16 
 
 		 218 aa  267  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  70.81 
 
 		 235 aa  265  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  64.29 
 
 		 245 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  64.25 
 
 		 225 aa  262  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  65.61 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  64.55 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  67.21 
 
 		 211 aa  259  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  62.98 
 
 		 241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  60.36 
 
 		 228 aa  254  9e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  62.56 
 
 		 231 aa  253  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  61.27 
 
 		 223 aa  248  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  60.61 
 
 		 217 aa  237  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  48.79 
 
 		 205 aa  229  3e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  55.19 
 
 		 222 aa  226  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  53 
 
 		 232 aa  224  9e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  44.02 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  45.71 
 
 		 214 aa  209  3e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  42.11 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  46.27 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  43.63 
 
 		 224 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  44.21 
 
 		 226 aa  144  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  42.57 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  41.27 
 
 		 205 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  42.21 
 
 		 212 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  43.16 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  40.98 
 
 		 203 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  37.3 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  42.35 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0299  lipoate-protein ligase B  36.89 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479336 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  37.88 
 
 		 233 aa  134  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  38.38 
 
 		 227 aa  135  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  41.76 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2500  lipoate-protein ligase B  38.73 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0294  lipoate-protein ligase B  36.89 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1554  lipoate-protein ligase B  37.91 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00660992  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  37.88 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1669  lipoyltransferase  37.93 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  37.37 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  35.68 
 
 		 199 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  38.38 
 
 		 213 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  37.88 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  41.76 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  38.21 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  41.76 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  40.59 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  41.76 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  41.76 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  41.76 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  41.76 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  41.76 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3935  lipoate-protein ligase B  35.75 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385529  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0323  lipoate-protein ligase B  45.61 
 
 		 229 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  40.19 
 
 		 221 aa  131  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1962  lipoyltransferase  36.71 
 
 		 214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0243  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  37.91 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0411  lipoate-protein ligase B  35.96 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  39.41 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  39.41 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  38.82 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1162  lipoate-protein ligase B  36.14 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  38.82 
 
 		 215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0216  lipoate-protein ligase B  40.82 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  36.14 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000234389  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1050  lipoate-protein ligase B  36.14 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000221543  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0989  lipoate-protein ligase B  35.64 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000765019  normal  0.947526 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3029  lipoate-protein ligase B  40.37 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3155  lipoate-protein ligase B  37.36 
 
 		 219 aa  129  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0237  lipoate-protein ligase B  37.38 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.543697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1551  lipoate-protein ligase B  43.12 
 
 		 220 aa  128  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0185  lipoate-protein ligase B  48.25 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.901872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>