66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2482 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2482  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 189 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.097083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2442  2',5' RNA ligase  60.31 
 
 		 196 aa  204  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2222  hypothetical protein  47.4 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1443  putative ligase protein  48 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2337  Phosphoesterase HXTX  46.43 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1384  2'-5' RNA ligase  46.02 
 
 		 222 aa  130  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.605515  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2006  2'-5' RNA ligase  42.11 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1320  2'-5' RNA ligase  46.02 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0321525  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01767  2'-5' RNA ligase  41.36 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.680529  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1918  putative ligase  43.37 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102106  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1982  2'-5' RNA ligase  41.88 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6095  2',5' RNA ligase  41.88 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0652023  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1290  2'-5' RNA ligase  42.02 
 
 		 195 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2787  2'-5' RNA ligase  45.03 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.320306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1350  2'-5' RNA ligase-like protein  39.53 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4293  2',5' RNA ligase  35.43 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.775847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4557  2',5' RNA ligase  33.91 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0162437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3202  hypothetical protein  33.9 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59985  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2421  2',5' RNA ligase  34.68 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0368864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1426  2',5' RNA ligase  34.1 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0723245  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  33.88 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2125  2',5' RNA ligase  27.17 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2923  2',5' RNA ligase  39.25 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916331  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  32.94 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3455  2'-5' RNA ligase  30.98 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00917798  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0158  2'-5' RNA ligase  31.15 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0758236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0151  2'-5' RNA ligase  30.98 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000646366  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0150  2'-5' RNA ligase  30.98 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345552  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00146  2'-5' RNA ligase  30.98 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00154345  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0138  2'-5' RNA ligase  30.98 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0169609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00145  hypothetical protein  30.98 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0156  2'-5' RNA ligase  30.43 
 
 		 176 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.177994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3512  2'-5' RNA ligase  30.98 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0807667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0220  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0687  2'-5' RNA ligase  31.22 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00185494  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0222  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367161  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0204  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0408  2'-5' RNA ligase  37.25 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0205  2'-5' RNA ligase  32.78 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0216  2'-5' RNA ligase  32.96 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  22.7 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  40.95 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23030  2-5 RNA ligase protein  31.45 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  29.14 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  31.85 
 
 		 170 aa  44.7  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1635  2'-5' RNA ligase  30.36 
 
 		 170 aa  44.7  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0512  2'-5' RNA ligase  31.45 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  34.81 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2424  2'-5' RNA ligase  32.96 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  35.58 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3126  2'-5' RNA ligase  26.19 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  31.62 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  22.3 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5472  2'-5' RNA ligase  31.58 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  33.11 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  36.54 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  23.66 
 
 		 173 aa  42  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3271  2'-5' RNA ligase  31.46 
 
 		 181 aa  42  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  26.03 
 
 		 186 aa  42  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  27.54 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3336  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00058753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3466  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  37.5 
 
 		 178 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1166  2'-5' RNA ligase  29.41 
 
 		 176 aa  41.2  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>