More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7869 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 134 aa  271  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  52.31 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  44.96 
 
 		 402 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  45.1 
 
 		 394 aa  90.5  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 140 aa  87  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  44.92 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  44.92 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  44.92 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  40.48 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  44.62 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  38.06 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  41.94 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  41.94 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  43.69 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  37.23 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  48.15 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  43.18 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  33.98 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  38.83 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07405  Endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  41.75 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  39.62 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  43.68 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  39.71 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01013  hypothetical protein  33 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2632  Endoribonuclease L-PSP  33 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.763803  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1128  rutC protein  33 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  40.78 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  41.38 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1125  rutC protein  33 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2585  endoribonuclease L-PSP  33 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0607666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  36.7 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2115  rutC protein  33 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  42.34 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01020  hypothetical protein  33 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  33 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  38.97 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  32.79 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5509  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  36.59 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  36.51 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  44.66 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  35.92 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  41.51 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5501  endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1821  endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.012204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1158  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0195416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>