More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7785 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  818    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  53.85 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  48.05 
 
 		 417 aa  354  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  48.4 
 
 		 414 aa  312  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  45.57 
 
 		 416 aa  275  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 		 441 aa  256  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  43.38 
 
 		 408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  35.76 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 		 423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  42.14 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 439 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 426 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  36.93 
 
 		 414 aa  206  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 428 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 		 432 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 444 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 		 415 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 439 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 450 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  35.83 
 
 		 401 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  28.79 
 
 		 414 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  29.05 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  28.28 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 429 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  32.41 
 
 		 415 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  31.9 
 
 		 408 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  32.15 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  32.89 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  32.89 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  32.89 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  32.15 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 421 aa  123  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 417 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.95 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  32.15 
 
 		 406 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 434 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25.18 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 413 aa  111  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 413 aa  111  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.2 
 
 		 408 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.57 
 
 		 408 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 451 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  25.3 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.3 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.3 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0482  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.855857 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  25.42 
 
 		 408 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  29.63 
 
 		 411 aa  106  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 416 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 437 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 433 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  22.67 
 
 		 410 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 499 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 474 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  28.68 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 440 aa  94.4  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 463 aa  94  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 467 aa  93.6  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  29.79 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 421 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  29.34 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  29.34 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  29.52 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 427 aa  90.9  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 410 aa  90.9  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  29.52 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>