156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7580 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7580  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 
224 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0422  hydrolase  46.15 
 
 
215 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0352  hydrolase  45.67 
 
 
215 aa  164  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0956  putative phosphatase  42.11 
 
 
224 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0786  HAD-superfamily hydrolase  40.38 
 
 
210 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1438  hypothetical protein  38.54 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5694  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  39.42 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556645  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1711  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  39.81 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0940062  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3254  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.05 
 
 
224 aa  128  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.81 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.10706  normal  0.0227644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3529  hydrolase  27.59 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.188374  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  25.63 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.15 
 
 
218 aa  59.3  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  27.09 
 
 
221 aa  58.9  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  27.09 
 
 
221 aa  58.9  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  24.86 
 
 
219 aa  58.5  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.76 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  27.03 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.96 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3478  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.89 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.09 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  24.6 
 
 
207 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100035  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  21.13 
 
 
211 aa  55.5  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  25.45 
 
 
227 aa  55.1  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  25.5 
 
 
225 aa  55.1  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  22.45 
 
 
222 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1760  HAD family hydrolase  23.9 
 
 
260 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.960773  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.38 
 
 
225 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.66 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1462  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  21.05 
 
 
330 aa  52.4  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.88 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  26.9 
 
 
223 aa  52.4  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  23.96 
 
 
230 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  22.12 
 
 
235 aa  52.4  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  24.48 
 
 
230 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  22.84 
 
 
221 aa  52  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1903  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.31 
 
 
213 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  26.15 
 
 
221 aa  51.6  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  25.37 
 
 
225 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1056  putative periplasmic protein  24.6 
 
 
207 aa  51.6  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0228325  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  25.63 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  23.23 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  23.96 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  23.91 
 
 
215 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  24.49 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  26.5 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2045  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.68 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  22.58 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  23.38 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.29 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  24.29 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  24.02 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  23.98 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  25.52 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  22.28 
 
 
221 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  22.96 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  22.73 
 
 
216 aa  48.9  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.63 
 
 
218 aa  48.9  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2085  HAD family hydrolase  24.62 
 
 
223 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  32.65 
 
 
246 aa  48.9  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  22.92 
 
 
221 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.5 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  24.76 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  21.97 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.45 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  24.37 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1758  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  21.16 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0639278  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  24.44 
 
 
247 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1175  HAD family hydrolase  22.53 
 
 
222 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341694  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  21.72 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  20.21 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  22 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  22.8 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.91 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  23.2 
 
 
272 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 
223 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  23.12 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  21.76 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4573  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.31 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  24.32 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.54 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  24.87 
 
 
230 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  23 
 
 
273 aa  45.8  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.5 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  30.5 
 
 
196 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  26.83 
 
 
241 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  22.93 
 
 
225 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  22.93 
 
 
225 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  22.93 
 
 
225 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.66 
 
 
228 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  24.75 
 
 
222 aa  45.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  25.12 
 
 
231 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  19.69 
 
 
216 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2015  phosphoglycolate phosphatase  21.65 
 
 
213 aa  45.1  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000565741  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  21.78 
 
 
227 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2259  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  21.65 
 
 
211 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.70035e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2014  phosphoglycolate phosphatase  21.65 
 
 
213 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>