More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7020 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7020  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 540 aa  1042    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  47.09 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  54.05 
 
 		 469 aa  375  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  47.09 
 
 		 463 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  45.12 
 
 		 464 aa  365  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  45.4 
 
 		 465 aa  363  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  45.96 
 
 		 458 aa  349  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  51.08 
 
 		 460 aa  347  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  50 
 
 		 482 aa  347  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2984  xylulokinase  46.89 
 
 		 482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.765011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  42.96 
 
 		 492 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  44.35 
 
 		 464 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  42.42 
 
 		 479 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  44.13 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  45.42 
 
 		 486 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  44.4 
 
 		 465 aa  322  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0644  xylulokinase  41.98 
 
 		 480 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632042  normal  0.0960286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  45.07 
 
 		 460 aa  314  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  44.13 
 
 		 475 aa  311  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  44.98 
 
 		 465 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  44.98 
 
 		 465 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  44.77 
 
 		 465 aa  302  9e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  47.38 
 
 		 466 aa  300  6e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  39 
 
 		 490 aa  297  3e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  43.85 
 
 		 495 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  42.29 
 
 		 464 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  37.78 
 
 		 480 aa  277  4e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  42.56 
 
 		 479 aa  276  6e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  42.37 
 
 		 505 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  42.96 
 
 		 463 aa  270  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  44.21 
 
 		 472 aa  270  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  34.77 
 
 		 506 aa  238  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  37.24 
 
 		 493 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  37.24 
 
 		 493 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  36.99 
 
 		 493 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  30.93 
 
 		 498 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  31.5 
 
 		 496 aa  160  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  32.77 
 
 		 495 aa  158  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  29.17 
 
 		 493 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  31.57 
 
 		 498 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  29.1 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  28.6 
 
 		 493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  30.32 
 
 		 496 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  30.02 
 
 		 502 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  29.86 
 
 		 496 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  28.47 
 
 		 499 aa  137  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  27.38 
 
 		 498 aa  136  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  26.68 
 
 		 505 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  27.82 
 
 		 497 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  27.35 
 
 		 496 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.45 
 
 		 518 aa  118  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  25.19 
 
 		 501 aa  110  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  26.06 
 
 		 492 aa  106  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  26.06 
 
 		 492 aa  106  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  27.5 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  28.57 
 
 		 498 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  28.41 
 
 		 493 aa  100  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  29.49 
 
 		 493 aa  98.2  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.22 
 
 		 500 aa  97.8  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  28.13 
 
 		 493 aa  97.8  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  27.68 
 
 		 491 aa  97.1  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  24.73 
 
 		 509 aa  97.1  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  24.14 
 
 		 511 aa  96.7  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  28.12 
 
 		 488 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  28.12 
 
 		 488 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  28.88 
 
 		 490 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  25.05 
 
 		 502 aa  94.7  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  29.06 
 
 		 490 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  28.88 
 
 		 490 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  29.06 
 
 		 490 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  27.29 
 
 		 484 aa  94.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  27.93 
 
 		 483 aa  94.4  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  27.38 
 
 		 484 aa  93.6  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  25.98 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  26.84 
 
 		 485 aa  92.8  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  27.63 
 
 		 488 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  26.67 
 
 		 504 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  26.14 
 
 		 509 aa  92  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  27.51 
 
 		 494 aa  92  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  27.05 
 
 		 484 aa  91.3  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  28.06 
 
 		 472 aa  91.3  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  27.05 
 
 		 484 aa  91.3  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  28.43 
 
 		 493 aa  90.9  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  28.67 
 
 		 493 aa  90.1  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  28.67 
 
 		 493 aa  90.1  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  28.67 
 
 		 493 aa  90.1  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  26.2 
 
 		 506 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  27.14 
 
 		 486 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  26.78 
 
 		 483 aa  89.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1235  xylulokinase  30.71 
 
 		 480 aa  89  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.757817  normal  0.113808 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  26.78 
 
 		 483 aa  89  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  27.64 
 
 		 493 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  26.59 
 
 		 488 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  28.84 
 
 		 493 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  28.84 
 
 		 493 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  29.78 
 
 		 489 aa  87.8  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  27.99 
 
 		 491 aa  87  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  28.21 
 
 		 493 aa  87  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  28.19 
 
 		 488 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  26.93 
 
 		 484 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>