49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5101 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  447  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  62.5 
 
 		 233 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  50.43 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  49.09 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  51.83 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  43.1 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  43.1 
 
 		 232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  50.45 
 
 		 221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  43.1 
 
 		 232 aa  193  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  44.54 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  45.91 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  42.67 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  44.55 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  41.18 
 
 		 216 aa  156  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  38.18 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  36.49 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  34.55 
 
 		 213 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  34.55 
 
 		 213 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  34.09 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  36.49 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  35.45 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  35.45 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  35.45 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  35.45 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.66 
 
 		 1265 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.68 
 
 		 1503 aa  66.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.99 
 
 		 1274 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  26.63 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  30.54 
 
 		 375 aa  62.4  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  31.29 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  22.94 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  26.51 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.29 
 
 		 1180 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  28.72 
 
 		 392 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.65 
 
 		 1505 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0213  hypothetical protein  26.04 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2558  hypothetical protein  26.32 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000292512  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  22.7 
 
 		 1182 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.64 
 
 		 1171 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  26.54 
 
 		 260 aa  45.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  25.25 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  25.51 
 
 		 1444 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  25.57 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  25 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  20.29 
 
 		 1151 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  23.38 
 
 		 1135 aa  42.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  24.46 
 
 		 1138 aa  41.6  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>