More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4892 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4892  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
252 aa  497  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2343  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  79.76 
 
 
252 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000394864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4893  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70.12 
 
 
254 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70.28 
 
 
250 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07030  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  73.11 
 
 
255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.48 
 
 
255 aa  333  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4337  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.4 
 
 
269 aa  334  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765282  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1386  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.6 
 
 
263 aa  327  9e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315902  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1368  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  71.6 
 
 
263 aa  327  9e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4164  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.34 
 
 
254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1402  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.2 
 
 
263 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.893267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.48 
 
 
274 aa  325  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7914  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70.24 
 
 
240 aa  323  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.8 
 
 
261 aa  322  5e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839059 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08500  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.43 
 
 
259 aa  321  6e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.494503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12526  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase alpha subunit scoA  68.92 
 
 
248 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399784  normal  0.0529319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0330  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.63 
 
 
257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2504  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  65.1 
 
 
263 aa  311  5.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.361118  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07610  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.02 
 
 
269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0351  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.55 
 
 
236 aa  278  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.901849  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  55.82 
 
 
229 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.01 
 
 
229 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  56.92 
 
 
233 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  58.33 
 
 
232 aa  271  9e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56 
 
 
233 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.82 
 
 
236 aa  270  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  56.75 
 
 
234 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  56.35 
 
 
234 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  56.35 
 
 
234 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  56.35 
 
 
234 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  56.35 
 
 
234 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1563  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.75 
 
 
234 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  56.35 
 
 
234 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  56.35 
 
 
234 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  56.75 
 
 
302 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2761  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.95 
 
 
234 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527249  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.2 
 
 
235 aa  265  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.35 
 
 
233 aa  265  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  54.22 
 
 
237 aa  264  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.6 
 
 
233 aa  264  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  56.75 
 
 
244 aa  263  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.78 
 
 
235 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1163  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  53.78 
 
 
235 aa  261  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05669  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase (ScoT), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12250)  53.41 
 
 
519 aa  261  6.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.56 
 
 
234 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.52 
 
 
272 aa  260  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1598  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, alpha subunit  56.8 
 
 
239 aa  259  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.844563  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  53.6 
 
 
237 aa  259  3e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1390  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.16 
 
 
234 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4610  3-oxoacid CoA-transferase  55.16 
 
 
234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000693974  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  59.49 
 
 
244 aa  258  7e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1153  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  58.33 
 
 
232 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2918  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.79 
 
 
233 aa  257  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000077275 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.59 
 
 
234 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  50.8 
 
 
253 aa  254  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0590  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.39 
 
 
232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1706  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.8 
 
 
233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6963  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.6 
 
 
231 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.550727  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.57 
 
 
233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.82 
 
 
270 aa  252  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.19 
 
 
234 aa  251  6e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.98 
 
 
235 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.78 
 
 
245 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.17 
 
 
245 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.59 
 
 
234 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.59 
 
 
234 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.98 
 
 
245 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.98 
 
 
245 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.39 
 
 
233 aa  249  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.79 
 
 
234 aa  249  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5001  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.04 
 
 
246 aa  248  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0462314  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1892  acetate CoA-transferase, subunit A  51.19 
 
 
234 aa  248  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.1 
 
 
237 aa  248  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.19 
 
 
255 aa  248  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.2 
 
 
231 aa  248  9e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.79 
 
 
234 aa  248  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.6 
 
 
244 aa  247  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  53.97 
 
 
238 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1714  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.79 
 
 
234 aa  247  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4683  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.41 
 
 
245 aa  247  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.728384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.63 
 
 
237 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1453  3-oxoacid CoA-transferase  50.4 
 
 
237 aa  246  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00126643  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1914  3-ketoacid CoA transferase alpha subunit  51.98 
 
 
232 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507414  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1670  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  52.21 
 
 
235 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.835044  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.98 
 
 
232 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.79 
 
 
239 aa  246  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1525  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.79 
 
 
234 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2978  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.79 
 
 
234 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01941  putative succinyl-CoA transferase, alpha subunit  50.6 
 
 
235 aa  246  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546528  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2851  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.79 
 
 
234 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.79 
 
 
234 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1366  3-oxoacid CoA-transferase  56.35 
 
 
234 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1505  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.8 
 
 
237 aa  245  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571069  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0517  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.5 
 
 
243 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.18 
 
 
238 aa  244  6.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1667  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.79 
 
 
234 aa  244  8e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.34 
 
 
233 aa  244  9e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  53.97 
 
 
238 aa  244  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.18 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>