171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2316 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 302 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  42.28 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  44.44 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  36.68 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.46 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.99 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 321 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  37.4 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  36.03 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.77 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  29.31 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.54 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2593  hypothetical protein  31.67 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.04 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  24.92 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  26.28 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  23.1 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.41 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  28.72 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  24.84 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  30.2 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  24.21 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  29.17 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  33.46 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.93 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  24.73 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  31.58 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  24.44 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  31.6 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.16 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  23.68 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  28.97 
 
 		 314 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  30.98 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  24.92 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.27 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  33.19 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  28.1 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  23.97 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  23.51 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.19 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.25 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  21.17 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  29.96 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  31.54 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  31.54 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.12 
 
 		 282 aa  53.5  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.04 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  25.43 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  29.21 
 
 		 321 aa  52.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  23.89 
 
 		 315 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37570  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  31.69 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295733  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0882  hypothetical protein  27.21 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000008536  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  30.47 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  31.67 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  27.18 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.54 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.75 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  31.58 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  30.04 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.15 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  24.21 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  30.45 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.28 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  30.99 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  29.82 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  24.03 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  29.59 
 
 		 316 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  27.21 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.08 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.48 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.08 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.08 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  28.24 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  25 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 		 335 aa  48.9  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 298 aa  48.9  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.32 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  22.58 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  25.1 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  35.9 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  22.08 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.04 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  21.77 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  21.38 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  33.8 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.02 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.67 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  29.06 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.48 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.33 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  30.08 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0584  SMR family transporter PecM  28.16 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>