More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1994 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  100 
 
 		 1207 aa  2445    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  58.52 
 
 		 1128 aa  1330    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1956  glycoside hydrolase family protein  31.07 
 
 		 927 aa  314  7.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0133  glycoside hydrolase family 31  31.44 
 
 		 798 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1877  glycoside hydrolase family protein  29.73 
 
 		 797 aa  303  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0196  alpha-glucosidase  29.06 
 
 		 829 aa  290  1e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.193664  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15100  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  34.28 
 
 		 816 aa  281  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4758  glycoside hydrolase family 31  32.87 
 
 		 761 aa  279  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1316  alpha-glucosidase  32.05 
 
 		 845 aa  271  5.9999999999999995e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.168857  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1288  glycosyl hydrolase, family 31  29.45 
 
 		 915 aa  263  1e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0765  alpha-glucosidase  31.46 
 
 		 739 aa  261  4e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10935  hypothetical protein  31.76 
 
 		 813 aa  238  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.74 
 
 		 1072 aa  223  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.23 
 
 		 627 aa  192  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  26.27 
 
 		 801 aa  191  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  23.51 
 
 		 770 aa  188  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  27.19 
 
 		 944 aa  187  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  26.52 
 
 		 969 aa  187  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  25.44 
 
 		 836 aa  174  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  28.18 
 
 		 765 aa  174  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  27.6 
 
 		 765 aa  174  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  27.25 
 
 		 760 aa  173  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  23.88 
 
 		 973 aa  169  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  22.67 
 
 		 752 aa  168  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  27.78 
 
 		 804 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  26.24 
 
 		 779 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  26.5 
 
 		 783 aa  162  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  26.03 
 
 		 951 aa  162  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  27.06 
 
 		 797 aa  161  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  27.65 
 
 		 785 aa  160  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  26.41 
 
 		 779 aa  159  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  23.36 
 
 		 791 aa  159  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  27.67 
 
 		 766 aa  158  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  25.58 
 
 		 779 aa  157  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  23.79 
 
 		 803 aa  156  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  30.63 
 
 		 828 aa  154  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  25.09 
 
 		 836 aa  154  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  24.91 
 
 		 794 aa  154  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  25.59 
 
 		 1024 aa  151  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  26.3 
 
 		 806 aa  151  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  26.04 
 
 		 760 aa  151  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  24.96 
 
 		 1016 aa  150  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  24.38 
 
 		 746 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  24.79 
 
 		 821 aa  150  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  26.88 
 
 		 749 aa  149  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  26.28 
 
 		 777 aa  149  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  26.13 
 
 		 771 aa  149  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  24.57 
 
 		 799 aa  149  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  25.19 
 
 		 821 aa  147  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  29.37 
 
 		 776 aa  147  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  26.96 
 
 		 774 aa  144  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  26 
 
 		 815 aa  144  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  25.06 
 
 		 775 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  26.35 
 
 		 760 aa  142  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  26.13 
 
 		 779 aa  142  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  42.58 
 
 		 634 aa  142  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  25.51 
 
 		 681 aa  140  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  28.32 
 
 		 777 aa  141  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  54.96 
 
 		 492 aa  139  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  24.48 
 
 		 792 aa  138  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  24.69 
 
 		 780 aa  138  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  26.64 
 
 		 839 aa  138  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  24.49 
 
 		 768 aa  138  8e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  25.14 
 
 		 743 aa  137  9e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  24.9 
 
 		 791 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  25.72 
 
 		 775 aa  136  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  22.8 
 
 		 840 aa  135  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  24.08 
 
 		 757 aa  135  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  26.4 
 
 		 763 aa  134  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  25.47 
 
 		 798 aa  133  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  24.34 
 
 		 764 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  23.46 
 
 		 712 aa  130  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  23.89 
 
 		 764 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  25.55 
 
 		 679 aa  130  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  25.55 
 
 		 679 aa  130  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  53.33 
 
 		 801 aa  130  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  33.67 
 
 		 784 aa  130  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  26.32 
 
 		 695 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  25.33 
 
 		 679 aa  129  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.97 
 
 		 933 aa  128  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  25.33 
 
 		 679 aa  129  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  24.17 
 
 		 845 aa  128  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  25.33 
 
 		 679 aa  128  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  51.8 
 
 		 417 aa  128  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  25.11 
 
 		 661 aa  128  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0244988 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  24.62 
 
 		 699 aa  127  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.05 
 
 		 788 aa  127  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  23.78 
 
 		 772 aa  127  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  24.6 
 
 		 788 aa  127  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  25.66 
 
 		 690 aa  127  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  50 
 
 		 890 aa  127  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  24.45 
 
 		 775 aa  126  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  24.48 
 
 		 788 aa  125  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  37.02 
 
 		 732 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  25.11 
 
 		 795 aa  126  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  27.84 
 
 		 795 aa  124  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  27.84 
 
 		 795 aa  124  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  22.15 
 
 		 752 aa  124  9.999999999999999e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  25.84 
 
 		 794 aa  124  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  23.71 
 
 		 799 aa  124  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>