More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2250 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  49.1 
 
 		 872 aa  793    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  40.96 
 
 		 891 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  45.12 
 
 		 876 aa  735    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  46.21 
 
 		 877 aa  778    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  46.33 
 
 		 877 aa  780    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  46.78 
 
 		 876 aa  755    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  43.74 
 
 		 880 aa  676    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  47.23 
 
 		 877 aa  795    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  46.21 
 
 		 891 aa  777    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  46.21 
 
 		 891 aa  778    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  46.21 
 
 		 891 aa  777    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  49.71 
 
 		 870 aa  790    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  45.16 
 
 		 888 aa  740    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  46.39 
 
 		 879 aa  753    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  49.67 
 
 		 894 aa  836    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  46.78 
 
 		 876 aa  755    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  43.2 
 
 		 878 aa  729    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  45.33 
 
 		 876 aa  764    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  46.1 
 
 		 877 aa  779    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  47.17 
 
 		 883 aa  784    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  40.54 
 
 		 891 aa  660    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  41 
 
 		 875 aa  658    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  42.84 
 
 		 868 aa  672    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  46.21 
 
 		 877 aa  778    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  48.1 
 
 		 896 aa  776    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  46.67 
 
 		 877 aa  779    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  42.39 
 
 		 888 aa  676    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  43.71 
 
 		 885 aa  742    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  46.33 
 
 		 877 aa  779    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  43.6 
 
 		 895 aa  746    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  44.33 
 
 		 873 aa  733    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  46.89 
 
 		 878 aa  805    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  45.98 
 
 		 877 aa  775    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  100 
 
 		 866 aa  1731    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  98.38 
 
 		 866 aa  1710    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  42.63 
 
 		 866 aa  705    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  45.37 
 
 		 850 aa  709    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  41.25 
 
 		 878 aa  671    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  43.41 
 
 		 877 aa  669    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  41.07 
 
 		 903 aa  640    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  44.73 
 
 		 896 aa  719    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  44.09 
 
 		 879 aa  685    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1892  DNA polymerase I  42.92 
 
 		 930 aa  652    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  38.56 
 
 		 909 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  39.26 
 
 		 885 aa  634  1e-180  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  40.96 
 
 		 893 aa  631  1e-179  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  38.61 
 
 		 903 aa  626  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  37.18 
 
 		 906 aa  625  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  37.88 
 
 		 908 aa  624  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  39.09 
 
 		 912 aa  623  1e-177  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  39.89 
 
 		 892 aa  623  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  39.35 
 
 		 892 aa  621  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  39.15 
 
 		 892 aa  621  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  38.56 
 
 		 893 aa  621  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  38.2 
 
 		 920 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  37.8 
 
 		 903 aa  621  1e-176  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  38.2 
 
 		 920 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  37.09 
 
 		 902 aa  617  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  39.93 
 
 		 892 aa  619  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  36.18 
 
 		 945 aa  615  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  38.04 
 
 		 929 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  38.72 
 
 		 903 aa  617  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  37.12 
 
 		 901 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  39.09 
 
 		 902 aa  613  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  35.77 
 
 		 911 aa  612  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  37.15 
 
 		 904 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  38.4 
 
 		 939 aa  608  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  40.11 
 
 		 893 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  39.27 
 
 		 956 aa  607  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  36.23 
 
 		 933 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  40.76 
 
 		 893 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  39.4 
 
 		 939 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  39.44 
 
 		 892 aa  599  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  40.69 
 
 		 855 aa  601  1e-170  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  37.46 
 
 		 899 aa  600  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  36.69 
 
 		 899 aa  600  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  37.11 
 
 		 929 aa  596  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  38.19 
 
 		 926 aa  594  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  37.69 
 
 		 924 aa  595  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  38.78 
 
 		 936 aa  588  1e-166  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  35.66 
 
 		 910 aa  588  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  37.68 
 
 		 930 aa  587  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  38.37 
 
 		 949 aa  588  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  37.37 
 
 		 926 aa  583  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  36.72 
 
 		 884 aa  584  1.0000000000000001e-165  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  34.95 
 
 		 928 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  36.06 
 
 		 905 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  37.56 
 
 		 888 aa  582  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  35.02 
 
 		 912 aa  581  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  38.35 
 
 		 893 aa  581  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  35.76 
 
 		 889 aa  579  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2803  DNA polymerase I  39.06 
 
 		 994 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293267  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  36.47 
 
 		 893 aa  578  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  36.83 
 
 		 917 aa  576  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  35.7 
 
 		 910 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  35.87 
 
 		 904 aa  576  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  38.17 
 
 		 932 aa  573  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  35.5 
 
 		 908 aa  572  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  35.86 
 
 		 955 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  37.83 
 
 		 951 aa  569  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>