247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK01170 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009358  OSTLU_49280  predicted protein  37.09 
 
 		 2017 aa  1053    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.83375  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01170  DNA repair protein rad8, putative  100 
 
 		 1856 aa  3840    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06076  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09120)  29.8 
 
 		 2379 aa  610  1e-173  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45071  predicted protein  33.7 
 
 		 853 aa  435  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.706986  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45072  predicted protein  37.67 
 
 		 947 aa  223  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 		 1261 aa  77.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  27.2 
 
 		 900 aa  76.6  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45116  predicted protein  32.08 
 
 		 1843 aa  75.9  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116099  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  33.54 
 
 		 1163 aa  75.9  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  32.47 
 
 		 1068 aa  74.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  33.99 
 
 		 1120 aa  72.8  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  27.97 
 
 		 1110 aa  72  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  30.07 
 
 		 1080 aa  71.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15642  predicted protein  27.24 
 
 		 1432 aa  70.5  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.948384  normal  0.026294 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.29 
 
 		 1091 aa  70.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  30.29 
 
 		 985 aa  70.5  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.67 
 
 		 1227 aa  68.9  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  33.56 
 
 		 991 aa  68.9  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1171 aa  68.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 		 1160 aa  68.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.81 
 
 		 1069 aa  68.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  28.97 
 
 		 1209 aa  68.6  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.84 
 
 		 1068 aa  67.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  30 
 
 		 1068 aa  67.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  31.97 
 
 		 1154 aa  67.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  32.24 
 
 		 1150 aa  67.4  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  36.36 
 
 		 924 aa  67  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  31.76 
 
 		 872 aa  66.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  32.24 
 
 		 1130 aa  66.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  29.14 
 
 		 1003 aa  65.9  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  31.37 
 
 		 1086 aa  65.9  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4600  SNF2-related protein  32.19 
 
 		 746 aa  65.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  26.04 
 
 		 1068 aa  65.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 		 1104 aa  65.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  33.11 
 
 		 663 aa  65.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  30.34 
 
 		 1250 aa  63.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  30.99 
 
 		 1113 aa  64.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 1113 aa  64.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  29.82 
 
 		 1181 aa  63.5  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 		 1155 aa  63.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  31.91 
 
 		 964 aa  63.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  28.48 
 
 		 977 aa  63.9  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  26.04 
 
 		 1071 aa  63.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 		 1089 aa  63.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.46 
 
 		 1143 aa  63.5  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  31.91 
 
 		 773 aa  63.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.36 
 
 		 1082 aa  62.8  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  31.91 
 
 		 1112 aa  62.4  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59609  SNF2 family DNA-dependent ATPase  26.89 
 
 		 715 aa  62.4  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561177  normal  0.329781 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  30 
 
 		 1134 aa  62  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  31.21 
 
 		 1127 aa  62  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  30.26 
 
 		 1081 aa  61.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 		 925 aa  61.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  31.13 
 
 		 1091 aa  61.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 876 aa  60.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 		 1152 aa  60.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  33.78 
 
 		 1284 aa  60.1  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.46 
 
 		 1118 aa  60.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 		 1112 aa  60.1  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  31.33 
 
 		 1141 aa  60.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  27.24 
 
 		 1127 aa  60.1  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1088 aa  60.1  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1088 aa  59.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 		 933 aa  59.7  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.8 
 
 		 1110 aa  59.7  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 		 1066 aa  59.3  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  29.58 
 
 		 1096 aa  58.9  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2541  non-specific serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 		 922 aa  58.9  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893525 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  30.32 
 
 		 1100 aa  58.9  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  30.77 
 
 		 1381 aa  58.9  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.25 
 
 		 907 aa  58.9  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01040  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1277 aa  58.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  31.65 
 
 		 1185 aa  58.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  31.69 
 
 		 1069 aa  58.9  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  31.69 
 
 		 1069 aa  58.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  28.76 
 
 		 1086 aa  58.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  32.26 
 
 		 917 aa  58.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  27.27 
 
 		 1184 aa  58.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  25.45 
 
 		 972 aa  58.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  32.86 
 
 		 1159 aa  57.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  32.41 
 
 		 1357 aa  57.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  32.05 
 
 		 898 aa  57.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  30.12 
 
 		 1072 aa  57.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 		 1129 aa  57.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  30.2 
 
 		 988 aa  57.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 		 1090 aa  58.2  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 		 1102 aa  57.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  32.86 
 
 		 1084 aa  57.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  32.86 
 
 		 1084 aa  58.2  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  27.97 
 
 		 959 aa  58.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 		 1021 aa  57.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00044  DNA repair protein rad5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BHD6]  22.58 
 
 		 1202 aa  57.4  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  31.1 
 
 		 1198 aa  57.4  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.43 
 
 		 950 aa  57  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  32.68 
 
 		 1084 aa  57.4  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  30.2 
 
 		 1025 aa  57.4  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  32.45 
 
 		 1120 aa  57  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.56 
 
 		 1403 aa  56.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 918 aa  57  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  26.29 
 
 		 1161 aa  56.6  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>