116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF00310 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF00310  high-affinity methionine permease, putative  100 
 
 		 582 aa  1172    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09490  methionine transporter (Eurofung)  48.77 
 
 		 510 aa  484  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.769842 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45036  high affinity methionine permease  37.74 
 
 		 522 aa  334  2e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.245416  normal  0.788743 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01631  methionine transporter (Eurofung)  36.46 
 
 		 540 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.281549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69488  high affinity methionine permease  35.39 
 
 		 551 aa  294  4e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.649926  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07243  methionine transporter, putative (Eurofung)  32.56 
 
 		 557 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.366956  normal  0.430438 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02560  methionine transporter, putative (Eurofung)  31.15 
 
 		 560 aa  232  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.503958 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10319  amino acid transporter (Eurofung)  30.7 
 
 		 514 aa  210  5e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28954  very low affinity methionine permease  28.27 
 
 		 550 aa  182  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144807  normal  0.597745 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09379  amino acid transporter, partial (Eurofung)  37.44 
 
 		 184 aa  150  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0862011 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_11329  methionine permease  29.31 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.408127 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  24.55 
 
 		 609 aa  89  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09300  amino acid transporter (Eurofung)  21.73 
 
 		 614 aa  82.8  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.917977  normal  0.922161 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  23.28 
 
 		 499 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 482 aa  67  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 461 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  23.9 
 
 		 580 aa  64.3  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  22.66 
 
 		 484 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 441 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  22.65 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  27.2 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 495 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  22.81 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  23 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  24.45 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  20.64 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  22.89 
 
 		 480 aa  57  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  21.68 
 
 		 515 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 479 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 443 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 		 483 aa  55.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 455 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  20.86 
 
 		 520 aa  53.9  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  23.34 
 
 		 440 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  24.68 
 
 		 461 aa  53.5  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  25.91 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 452 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 474 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  23.84 
 
 		 461 aa  52.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  21.36 
 
 		 441 aa  51.6  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  21.48 
 
 		 503 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  21.54 
 
 		 486 aa  50.4  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 		 452 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  22.36 
 
 		 452 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1932  amino acid transporter  23.92 
 
 		 437 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.392371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  23.33 
 
 		 476 aa  50.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  21.99 
 
 		 502 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  23.08 
 
 		 472 aa  49.7  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 446 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  24.75 
 
 		 431 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  22.86 
 
 		 443 aa  48.9  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  21.74 
 
 		 516 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  20.82 
 
 		 495 aa  48.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  24.59 
 
 		 431 aa  47.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2274  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 		 407 aa  47.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  21.03 
 
 		 490 aa  47.8  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 532 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  23.35 
 
 		 543 aa  47.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  23.35 
 
 		 530 aa  47.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 		 555 aa  47.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08538  amino acid transporter (Eurofung)  21.38 
 
 		 507 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 532 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  23.38 
 
 		 468 aa  47  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  24.9 
 
 		 467 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6593  amino acid permease-associated region  22.42 
 
 		 594 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  20.34 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  24.7 
 
 		 543 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 491 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  21.81 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  22.81 
 
 		 513 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  26.42 
 
 		 462 aa  45.8  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  23.71 
 
 		 487 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 		 452 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  20.94 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 516 aa  46.2  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  23.27 
 
 		 463 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 532 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 532 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 504 aa  45.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 532 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1095  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.212668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  25.66 
 
 		 532 aa  45.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 		 486 aa  45.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  20.91 
 
 		 502 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 		 546 aa  45.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  24.47 
 
 		 446 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  26.52 
 
 		 466 aa  44.7  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 466 aa  44.3  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  23.3 
 
 		 470 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  23.79 
 
 		 480 aa  44.3  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  23.3 
 
 		 470 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  23.3 
 
 		 470 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  24.58 
 
 		 532 aa  44.3  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01910  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  25.65 
 
 		 488 aa  44.3  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>