218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6593 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0922  amino acid permease-associated region  62.63 
 
 		 571 aa  716    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6593  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 594 aa  1181    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438666 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3606  amino acid permease-associated region  62.39 
 
 		 571 aa  715    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5657  amino acid permease-associated region  96.13 
 
 		 594 aa  1143    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3317  amino acid permease-associated region  89.06 
 
 		 594 aa  1072    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5964  amino acid permease-associated region  50.92 
 
 		 559 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3183  amino acid permease-associated region  49.42 
 
 		 560 aa  559  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.577712  normal  0.0276792 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0446  amino acid permease-associated region  49.18 
 
 		 562 aa  543  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000198962  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5970  amino acid permease-associated region  46.87 
 
 		 546 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699386  normal  0.10331 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5831  amino acid permease-associated region  45.6 
 
 		 545 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0481  putative amino acid transporter  47.31 
 
 		 551 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.483178  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2118  hypothetical protein  47.31 
 
 		 551 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.755576  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0581  amino acid transporter  46.63 
 
 		 551 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0700  amino acid permease  47.31 
 
 		 551 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.163425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0996  amino acid permease  47.31 
 
 		 551 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858254  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0838  amino acid permease  47.31 
 
 		 551 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0750  amino acid permease  47.31 
 
 		 551 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1969  amino acid permease  47.31 
 
 		 551 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5012  amino acid permease-associated region  46.46 
 
 		 551 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3557  amino acid permease-associated region  46.68 
 
 		 551 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1858  amino acid transporter, putative  47.53 
 
 		 551 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540964  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3293  amino acid permease-associated region  46.51 
 
 		 551 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4487  amino acid permease-associated region  46.46 
 
 		 551 aa  492  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5075  amino acid permease-associated region  46.51 
 
 		 551 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5210  amino acid permease-associated region  46.34 
 
 		 551 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3293  amino acid permease-associated region  46.5 
 
 		 555 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4239  amino acid permease-associated region  46.18 
 
 		 551 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23200  amino acid transporter  35.62 
 
 		 541 aa  330  4e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3606  amino acid permease  29.78 
 
 		 508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.582205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2292  amino acid transporter  31.94 
 
 		 500 aa  127  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 		 490 aa  77.4  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5040  Amino acid transporter-like protein  28.74 
 
 		 472 aa  77  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  28.37 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  23.44 
 
 		 483 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  24.35 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  23.1 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  24.76 
 
 		 465 aa  54.7  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  26.95 
 
 		 468 aa  54.3  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  24 
 
 		 500 aa  53.9  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 		 490 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  24.69 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0683  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 471 aa  52.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 491 aa  51.6  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0755  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 		 474 aa  51.6  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.254398  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  23.74 
 
 		 463 aa  51.2  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 566 aa  50.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0749  arginine/ornithine antiporter  28.4 
 
 		 474 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000982146  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  26.47 
 
 		 444 aa  50.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  27.21 
 
 		 471 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4436  amino acid permease family protein  28.4 
 
 		 474 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0280359  normal  0.0537632 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0901  amino acid permease family protein  28.4 
 
 		 474 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.264525  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  24.19 
 
 		 427 aa  50.4  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0941  amino acid permease family protein  28.4 
 
 		 474 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000289126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0937  amino acid permease family protein  28.4 
 
 		 474 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1029  amino acid permease family protein  28.4 
 
 		 474 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.530326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0805  amino acid permease family protein  28.4 
 
 		 456 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0754  arginine/ornithine antiporter  28.4 
 
 		 474 aa  50.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  23.38 
 
 		 463 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  28.86 
 
 		 494 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0845  amino acid permease family protein  28.4 
 
 		 456 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 		 481 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 496 aa  49.7  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  26.5 
 
 		 480 aa  49.7  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  22.97 
 
 		 480 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2505  amino acid transporter  25.69 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  27.91 
 
 		 462 aa  49.7  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  27.61 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 503 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  27.14 
 
 		 464 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0629  amino acid permease family protein  23.04 
 
 		 465 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  22.02 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  25.37 
 
 		 486 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  27.14 
 
 		 464 aa  48.5  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0758  amino acid permease family protein  23.04 
 
 		 465 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  23.69 
 
 		 609 aa  48.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0596  amino acid permease family protein  23.04 
 
 		 465 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0684  amino acid permease family protein  23.04 
 
 		 465 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0540  arginine/ornithine antiporter protein  23.04 
 
 		 465 aa  48.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0540  arginine/ornithine antiporter protein  23.04 
 
 		 465 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00650316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 514 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  24.03 
 
 		 517 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 440 aa  48.1  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0542  amino acid permease-associated region  22.94 
 
 		 465 aa  47.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  25.56 
 
 		 420 aa  47.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  25.66 
 
 		 471 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  25.66 
 
 		 471 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1332  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 490 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0665  amino acid permease family protein  23.04 
 
 		 465 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1349  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 490 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.923637  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2328  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 		 467 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205758  normal  0.251139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1368  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 490 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.37 
 
 		 471 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  24.92 
 
 		 446 aa  47.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1740  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 493 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.532509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>