More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23200 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23200  amino acid transporter  100 
 
 		 541 aa  1084    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3183  amino acid permease-associated region  39.63 
 
 		 560 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.577712  normal  0.0276792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5831  amino acid permease-associated region  41.05 
 
 		 545 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0446  amino acid permease-associated region  39.96 
 
 		 562 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000198962  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5964  amino acid permease-associated region  39.42 
 
 		 559 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3293  amino acid permease-associated region  38.45 
 
 		 555 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0581  amino acid transporter  39.23 
 
 		 551 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5210  amino acid permease-associated region  39.04 
 
 		 551 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5012  amino acid permease-associated region  39.04 
 
 		 551 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4487  amino acid permease-associated region  39.23 
 
 		 551 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5075  amino acid permease-associated region  38.85 
 
 		 551 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3293  amino acid permease-associated region  38.85 
 
 		 551 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0838  amino acid permease  38.33 
 
 		 551 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0700  amino acid permease  38.33 
 
 		 551 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.163425  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0481  putative amino acid transporter  38.33 
 
 		 551 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.483178  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0996  amino acid permease  38.33 
 
 		 551 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858254  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1969  amino acid permease  38.33 
 
 		 551 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2118  hypothetical protein  38.33 
 
 		 551 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.755576  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0750  amino acid permease  38.33 
 
 		 551 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1858  amino acid transporter, putative  38.91 
 
 		 551 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540964  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3557  amino acid permease-associated region  38.85 
 
 		 551 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5970  amino acid permease-associated region  39.07 
 
 		 546 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699386  normal  0.10331 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4239  amino acid permease-associated region  39.47 
 
 		 551 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0922  amino acid permease-associated region  35.28 
 
 		 571 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5657  amino acid permease-associated region  35.96 
 
 		 594 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3606  amino acid permease-associated region  35.19 
 
 		 571 aa  343  5e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6593  amino acid permease-associated region  35.62 
 
 		 594 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3317  amino acid permease-associated region  36.26 
 
 		 594 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3606  amino acid permease  28.2 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.582205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2292  amino acid transporter  27.94 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5040  Amino acid transporter-like protein  25.17 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  24.14 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  24.14 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  23.21 
 
 		 555 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 490 aa  72.8  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  23.21 
 
 		 517 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  23.03 
 
 		 543 aa  71.6  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 576 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 		 544 aa  70.5  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  25.82 
 
 		 483 aa  66.2  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  23.72 
 
 		 528 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 530 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 543 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  23.95 
 
 		 559 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  23.76 
 
 		 533 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  24.67 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  23.02 
 
 		 532 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  23.29 
 
 		 528 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  23.76 
 
 		 533 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  23.76 
 
 		 533 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  23.76 
 
 		 533 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  23.76 
 
 		 533 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  23.76 
 
 		 533 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  23.76 
 
 		 533 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  23.76 
 
 		 533 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  23.41 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  23.91 
 
 		 483 aa  62  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  22.71 
 
 		 465 aa  62  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 		 545 aa  61.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  22.65 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 		 545 aa  61.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  22.39 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  23.45 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0596  amino acid permease family protein  22.17 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0684  amino acid permease family protein  22.17 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0758  amino acid permease family protein  21.57 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0540  arginine/ornithine antiporter protein  22.17 
 
 		 465 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00650316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0629  amino acid permease family protein  22.17 
 
 		 465 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0542  amino acid permease-associated region  21.01 
 
 		 465 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0540  arginine/ornithine antiporter protein  22.17 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  22.26 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  21.83 
 
 		 483 aa  57  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  20.76 
 
 		 469 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 		 536 aa  56.2  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  23.2 
 
 		 487 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  23.57 
 
 		 542 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0697  amino acid permease family protein  20.7 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4672  amino acid permease family protein  21.52 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.1139e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0665  amino acid permease family protein  20.92 
 
 		 465 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0537  amino acid permease-associated region  20.87 
 
 		 474 aa  55.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.198205  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  22.75 
 
 		 516 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  23.17 
 
 		 499 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  24.14 
 
 		 496 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 630 aa  55.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  24.91 
 
 		 460 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  21.9 
 
 		 485 aa  55.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0901  amino acid permease family protein  20.78 
 
 		 474 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.264525  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  21.44 
 
 		 521 aa  54.3  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  23.23 
 
 		 491 aa  53.9  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  24.81 
 
 		 471 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  21.4 
 
 		 491 aa  53.5  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  24.81 
 
 		 471 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  24.43 
 
 		 475 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  23.31 
 
 		 525 aa  53.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 476 aa  53.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  23.69 
 
 		 518 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>