More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5970 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3557  amino acid permease-associated region  63.99 
 
 		 551 aa  707    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5210  amino acid permease-associated region  63.81 
 
 		 551 aa  709    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5970  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 546 aa  1103    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699386  normal  0.10331 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1969  amino acid permease  64.9 
 
 		 551 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0481  putative amino acid transporter  64.9 
 
 		 551 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.483178  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0838  amino acid permease  64.71 
 
 		 551 aa  687    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5831  amino acid permease-associated region  65.47 
 
 		 545 aa  710    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3293  amino acid permease-associated region  64.86 
 
 		 555 aa  714    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2118  hypothetical protein  64.9 
 
 		 551 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.755576  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5075  amino acid permease-associated region  63.62 
 
 		 551 aa  707    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0581  amino acid transporter  63.62 
 
 		 551 aa  704    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5964  amino acid permease-associated region  61.73 
 
 		 559 aa  692    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1858  amino acid transporter, putative  62.27 
 
 		 551 aa  690    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540964  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0446  amino acid permease-associated region  58.71 
 
 		 562 aa  684    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000198962  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0700  amino acid permease  64.9 
 
 		 551 aa  689    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.163425  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3293  amino acid permease-associated region  63.62 
 
 		 551 aa  707    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4239  amino acid permease-associated region  63.23 
 
 		 551 aa  696    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3183  amino acid permease-associated region  60 
 
 		 560 aa  674    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.577712  normal  0.0276792 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4487  amino acid permease-associated region  63.62 
 
 		 551 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5012  amino acid permease-associated region  63.81 
 
 		 551 aa  707    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0750  amino acid permease  64.9 
 
 		 551 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0996  amino acid permease  64.9 
 
 		 551 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858254  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3606  amino acid permease-associated region  53.06 
 
 		 571 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0922  amino acid permease-associated region  52.09 
 
 		 571 aa  570  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3317  amino acid permease-associated region  47.46 
 
 		 594 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6593  amino acid permease-associated region  46.87 
 
 		 594 aa  525  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438666 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5657  amino acid permease-associated region  46.06 
 
 		 594 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23200  amino acid transporter  39.07 
 
 		 541 aa  376  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3606  amino acid permease  30.77 
 
 		 508 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.582205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2292  amino acid transporter  30.96 
 
 		 500 aa  170  7e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5040  Amino acid transporter-like protein  30.08 
 
 		 472 aa  88.2  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  22.3 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 		 473 aa  67  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  24.73 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  22.25 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  23.5 
 
 		 517 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1820  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 486 aa  62  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  24.88 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  22.31 
 
 		 555 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  23.49 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0241  amino acid permease  26.52 
 
 		 543 aa  59.7  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  28.44 
 
 		 503 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  23.42 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3885  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 		 538 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  28.71 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  29.05 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  23.89 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  24.29 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  24.91 
 
 		 483 aa  57  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1368  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 490 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1349  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 490 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.923637  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  21.43 
 
 		 454 aa  57  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  25.57 
 
 		 463 aa  57  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1332  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 490 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 500 aa  57  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  25.5 
 
 		 463 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  24.58 
 
 		 482 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 		 465 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 		 463 aa  56.6  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  25.72 
 
 		 482 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  22.38 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 		 471 aa  56.2  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  22.38 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  28.42 
 
 		 480 aa  56.2  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  23.98 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  24.34 
 
 		 532 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  22.38 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  22.5 
 
 		 499 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  24.91 
 
 		 460 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 532 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  23.92 
 
 		 517 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  23.93 
 
 		 476 aa  55.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  22.43 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  23.81 
 
 		 460 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  25.46 
 
 		 468 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  26.14 
 
 		 483 aa  54.7  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  25.46 
 
 		 468 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  25.46 
 
 		 468 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  22.74 
 
 		 533 aa  54.3  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  22.74 
 
 		 533 aa  54.3  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  22.74 
 
 		 533 aa  54.3  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  23.71 
 
 		 542 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 466 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  22.74 
 
 		 533 aa  54.3  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  22.74 
 
 		 533 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  22.74 
 
 		 533 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 466 aa  54.3  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  22.74 
 
 		 533 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>