More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003630 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  100 
 
 		 475 aa  954    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  90.53 
 
 		 475 aa  845    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  42.23 
 
 		 467 aa  356  6.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  42.23 
 
 		 467 aa  354  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  41.44 
 
 		 474 aa  346  7e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  41.44 
 
 		 474 aa  345  8.999999999999999e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  36.96 
 
 		 464 aa  306  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  36.96 
 
 		 464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  39.41 
 
 		 473 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  38.02 
 
 		 470 aa  290  3e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  38.02 
 
 		 476 aa  290  4e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  39.41 
 
 		 473 aa  283  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  34.48 
 
 		 474 aa  278  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  32.94 
 
 		 466 aa  270  4e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  33.77 
 
 		 469 aa  262  8.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  30.69 
 
 		 473 aa  248  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  30.43 
 
 		 494 aa  243  5e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  30.6 
 
 		 480 aa  227  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 		 508 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  31.21 
 
 		 445 aa  207  5e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  31.21 
 
 		 445 aa  206  7e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 		 495 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  27.61 
 
 		 473 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  27.61 
 
 		 473 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  27.61 
 
 		 473 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  27.61 
 
 		 473 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 495 aa  199  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  27.61 
 
 		 473 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 		 499 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  29.67 
 
 		 490 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  29.21 
 
 		 472 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  29 
 
 		 472 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  29.96 
 
 		 503 aa  194  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  27.31 
 
 		 506 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  28.03 
 
 		 506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.15 
 
 		 511 aa  190  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  27.82 
 
 		 511 aa  190  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  31.52 
 
 		 511 aa  190  5.999999999999999e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  28.21 
 
 		 511 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  28.21 
 
 		 511 aa  189  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.21 
 
 		 511 aa  189  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  28.21 
 
 		 511 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.21 
 
 		 511 aa  189  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  28.21 
 
 		 511 aa  189  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.21 
 
 		 511 aa  189  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  29.4 
 
 		 485 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  29.57 
 
 		 485 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 720 aa  143  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  24.89 
 
 		 494 aa  129  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  23.28 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  24.54 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 455 aa  113  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  23 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 481 aa  103  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  23.77 
 
 		 467 aa  103  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  24.35 
 
 		 476 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  21.95 
 
 		 489 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  24.6 
 
 		 495 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  24.37 
 
 		 495 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  21.89 
 
 		 489 aa  86.7  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1002  inner membrane transporter YcaM  25 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  25.49 
 
 		 497 aa  85.9  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  23.72 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1067  inner membrane transporter YcaM  25 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.154382  normal  0.709783 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0973  inner membrane transporter YcaM  25 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1082  inner membrane transporter YcaM  25 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1033  inner membrane transporter YcaM  25 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.843228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  28.1 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1400  amino acid permease family protein  24.65 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00116878  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  22.93 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1980  amino acid permease-associated region  22.82 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2045  amino acid permease-associated region  22.82 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1999  amino acid permease-associated region  22.82 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0525134  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2217  amino acid permease-associated region  23.49 
 
 		 503 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1212  amino acid permease yshA  24.31 
 
 		 498 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0367716  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4126  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 		 502 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.635081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  25.07 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2220  amino acid permease family protein  24.47 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52526 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00903  predicted transporter  24.73 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2697  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2744  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0976  amino acid permease family protein  24.73 
 
 		 540 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.953218  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1005  amino acid permease family protein  24.73 
 
 		 540 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00910  hypothetical protein  24.73 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1062  amino acid permease family protein  24.58 
 
 		 476 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0217  amino acid antiporter  25.08 
 
 		 782 aa  77.4  0.0000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002656  putative oxidoreductase  22.9 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  26.97 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  25.96 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  22.28 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  22.28 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  22.28 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  22.28 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  22.28 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  22.28 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  22.28 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  22.28 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  22.28 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0976  amino acid transporter  24.18 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046598 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3036  amino acid transporter  23.88 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0805799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>