More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2317 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  100 
 
 
472 aa  926    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  98.31 
 
 
472 aa  912    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  67.75 
 
 
503 aa  613  9.999999999999999e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  63.21 
 
 
485 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  62.77 
 
 
485 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  57.23 
 
 
511 aa  555  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  57.02 
 
 
511 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  57.02 
 
 
511 aa  554  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  57.05 
 
 
511 aa  553  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  57.02 
 
 
511 aa  554  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  57.02 
 
 
511 aa  554  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  57.02 
 
 
511 aa  554  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  57.02 
 
 
511 aa  554  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  57.02 
 
 
511 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  56.85 
 
 
720 aa  503  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  43.25 
 
 
511 aa  394  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  38.17 
 
 
494 aa  330  5.0000000000000004e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  36.84 
 
 
473 aa  329  9e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  34.28 
 
 
494 aa  263  6.999999999999999e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  31.97 
 
 
480 aa  244  3e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  29.76 
 
 
467 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  29.76 
 
 
467 aa  229  6e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  30.74 
 
 
464 aa  219  7e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  30.74 
 
 
464 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  29.12 
 
 
474 aa  218  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  32.43 
 
 
499 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  30.36 
 
 
466 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  30.02 
 
 
474 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  30.02 
 
 
474 aa  215  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 
508 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  30.17 
 
 
473 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  30.37 
 
 
490 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  30.17 
 
 
473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  32.57 
 
 
495 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 
495 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  30.08 
 
 
506 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  29.87 
 
 
506 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 
469 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  29.57 
 
 
475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  29 
 
 
475 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  24.73 
 
 
470 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  24.73 
 
 
476 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  24.84 
 
 
473 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  24.84 
 
 
473 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  24.63 
 
 
473 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  24.84 
 
 
473 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  24.84 
 
 
473 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0217  amino acid antiporter  31.46 
 
 
782 aa  144  3e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  25.17 
 
 
472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  26.8 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  26.55 
 
 
445 aa  127  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  25.06 
 
 
495 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  24.81 
 
 
495 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002656  putative oxidoreductase  24.1 
 
 
477 aa  94  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  24.55 
 
 
489 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  23.85 
 
 
489 aa  90.1  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1382  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 
501 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.320464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3545  amino acid permease family protein  22.88 
 
 
477 aa  87  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 
500 aa  87  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3372  amino acid permease family protein  22.71 
 
 
477 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3260  amino acid permease family protein  22.71 
 
 
477 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4392  amino acid permease family protein  22.71 
 
 
477 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02947  predicted transporter  22.4 
 
 
477 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0622  amino acid permease-associated region  22.4 
 
 
477 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 
455 aa  86.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4627  amino acid permease family protein  24.63 
 
 
514 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.592733  normal  0.0531629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04028  predicted transporter  24.36 
 
 
500 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.853032  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0623  amino acid permease-associated region  22.35 
 
 
477 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1400  amino acid permease family protein  25.97 
 
 
498 aa  84  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00116878  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03990  hypothetical protein  24.36 
 
 
489 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.826607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5674  amino acid permease family protein  24.15 
 
 
514 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270283  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3854  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 
500 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4715  amino acid permease family protein  24.47 
 
 
500 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.212622  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1212  amino acid permease yshA  25.28 
 
 
498 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0367716  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  22.67 
 
 
464 aa  83.2  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3834  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 
514 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4400  amino acid permease family protein  24.36 
 
 
500 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1975  amino acid permease-associated region  23.79 
 
 
496 aa  80.5  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  23.27 
 
 
500 aa  79.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 
497 aa  78.2  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1226  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 
497 aa  77.8  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03339  hypothetical protein  22.55 
 
 
476 aa  77  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0828  amino acid transporter  23.34 
 
 
502 aa  75.9  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000137053  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0973  inner membrane transporter YcaM  23.11 
 
 
473 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1082  inner membrane transporter YcaM  23.11 
 
 
473 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224417  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1005  amino acid permease family protein  22.93 
 
 
540 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0976  amino acid permease family protein  22.93 
 
 
540 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.953218  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1067  inner membrane transporter YcaM  23.11 
 
 
473 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.154382  normal  0.709783 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1002  inner membrane transporter YcaM  23.11 
 
 
473 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00910  hypothetical protein  22.93 
 
 
476 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00903  predicted transporter  22.93 
 
 
476 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1033  inner membrane transporter YcaM  23.11 
 
 
473 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.843228 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2744  amino acid permease-associated region  22.93 
 
 
476 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2697  amino acid permease-associated region  22.93 
 
 
476 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5194  putrescine transporter  23.71 
 
 
452 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2220  amino acid permease family protein  22.46 
 
 
476 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.52526 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1062  amino acid permease family protein  22.7 
 
 
476 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4763  inner membrane transporter YjeM  23.45 
 
 
500 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.520052 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4706  inner membrane transporter YjeM  23.45 
 
 
500 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.929482  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4623  inner membrane transporter YjeM  23.45 
 
 
500 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>