More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0470 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  931    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  99.79 
 
 
467 aa  927    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  60.17 
 
 
474 aa  556  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  60.17 
 
 
474 aa  556  1e-157  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  47.41 
 
 
464 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  47.63 
 
 
464 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  49.11 
 
 
473 aa  408  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  49.11 
 
 
473 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  43.82 
 
 
476 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  43.82 
 
 
470 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  41.56 
 
 
474 aa  366  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  37.42 
 
 
466 aa  352  8e-96  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  39.87 
 
 
494 aa  348  1e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  42.23 
 
 
475 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  37.44 
 
 
469 aa  343  5e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  42.42 
 
 
475 aa  335  9e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  37.83 
 
 
473 aa  333  5e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  37.87 
 
 
495 aa  322  8e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  38.46 
 
 
490 aa  306  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  36.91 
 
 
508 aa  303  5.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  36.58 
 
 
506 aa  299  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  36.87 
 
 
480 aa  298  2e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  35.48 
 
 
506 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  34.75 
 
 
499 aa  297  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  41.61 
 
 
445 aa  292  7e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  41.39 
 
 
445 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  32.35 
 
 
495 aa  259  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  32.06 
 
 
473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  32.06 
 
 
473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  32.06 
 
 
473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  32.06 
 
 
473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  31.85 
 
 
473 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  29.49 
 
 
503 aa  233  4.0000000000000004e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  31.38 
 
 
485 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  31.38 
 
 
485 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  29.76 
 
 
472 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  29.87 
 
 
472 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  30.67 
 
 
511 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.67 
 
 
511 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  30.67 
 
 
511 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.67 
 
 
511 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.67 
 
 
511 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.83 
 
 
511 aa  229  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.67 
 
 
511 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  30.67 
 
 
511 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  30.67 
 
 
511 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  30.97 
 
 
511 aa  210  4e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  30.28 
 
 
720 aa  199  9e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  27.08 
 
 
494 aa  173  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  28.15 
 
 
472 aa  160  5e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 
464 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 
455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 
500 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  24.14 
 
 
467 aa  121  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 
500 aa  120  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  26.76 
 
 
495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  26.76 
 
 
495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 
497 aa  116  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  23.51 
 
 
481 aa  114  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  24.66 
 
 
476 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  22.25 
 
 
465 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  26.96 
 
 
446 aa  93.6  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  28.08 
 
 
451 aa  87  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0973  inner membrane transporter YcaM  24.06 
 
 
473 aa  86.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1002  inner membrane transporter YcaM  24.06 
 
 
473 aa  86.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1082  inner membrane transporter YcaM  24.06 
 
 
473 aa  86.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224417  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1067  inner membrane transporter YcaM  24.06 
 
 
473 aa  86.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.154382  normal  0.709783 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1033  inner membrane transporter YcaM  24.06 
 
 
473 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.843228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  27.74 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3036  amino acid transporter  24.87 
 
 
464 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0805799  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1975  amino acid permease-associated region  25.22 
 
 
496 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  23.98 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002656  putative oxidoreductase  25.37 
 
 
477 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  21.7 
 
 
489 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03339  hypothetical protein  23.21 
 
 
476 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  21.75 
 
 
489 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0217  amino acid antiporter  22.67 
 
 
782 aa  78.2  0.0000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2220  amino acid permease family protein  23.11 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.52526 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00903  predicted transporter  23.29 
 
 
476 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2744  amino acid permease-associated region  23.29 
 
 
476 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397041  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1005  amino acid permease family protein  23.06 
 
 
540 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2697  amino acid permease-associated region  23.29 
 
 
476 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00910  hypothetical protein  23.29 
 
 
476 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0976  amino acid permease family protein  23.06 
 
 
540 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.953218  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 
474 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1062  amino acid permease family protein  23.29 
 
 
476 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 
452 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1995  amino acid transporter  26.02 
 
 
507 aa  74.3  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0293042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 
447 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1311  amino acid transporter  24.18 
 
 
516 aa  73.6  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130405  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2217  amino acid permease-associated region  23.94 
 
 
503 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  24.03 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 
444 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 
435 aa  69.7  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 
468 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2045  amino acid permease-associated region  23.34 
 
 
504 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708803  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02947  predicted transporter  24.26 
 
 
477 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0976  amino acid transporter  26.54 
 
 
470 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4896  D-alanine/D-serine/glycine permease  21.18 
 
 
473 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673653  normal  0.259186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>