More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_2121 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  100 
 
 		 476 aa  946    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  100 
 
 		 470 aa  934    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  50.33 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  50.54 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  43.82 
 
 		 467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  43.82 
 
 		 467 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  43.28 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  43.28 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  40.7 
 
 		 494 aa  337  1.9999999999999998e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  38.38 
 
 		 469 aa  327  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  38.3 
 
 		 474 aa  324  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  41.32 
 
 		 473 aa  320  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  41.32 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  35.2 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  38.4 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  38.02 
 
 		 475 aa  300  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  32.85 
 
 		 495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  34.43 
 
 		 473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  33.83 
 
 		 499 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  34.34 
 
 		 508 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  33.97 
 
 		 495 aa  259  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  33.57 
 
 		 490 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  32.09 
 
 		 480 aa  244  3e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  30.87 
 
 		 506 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  30.7 
 
 		 506 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  30.67 
 
 		 473 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  30.67 
 
 		 473 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  30.67 
 
 		 473 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  30.67 
 
 		 473 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  30.67 
 
 		 473 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.42 
 
 		 511 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  28.54 
 
 		 511 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  28.54 
 
 		 511 aa  202  7e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  28.54 
 
 		 511 aa  202  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.54 
 
 		 511 aa  202  7e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  28.54 
 
 		 511 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.54 
 
 		 511 aa  202  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.54 
 
 		 511 aa  202  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  27.56 
 
 		 503 aa  202  8e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.33 
 
 		 511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  31.5 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  31.5 
 
 		 445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  27.62 
 
 		 485 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  24.73 
 
 		 472 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  26.61 
 
 		 485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  24.73 
 
 		 472 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  26.95 
 
 		 720 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  28.21 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  24.84 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  24.09 
 
 		 511 aa  133  6e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  23.98 
 
 		 494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  25.97 
 
 		 495 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  25.97 
 
 		 495 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  27.13 
 
 		 464 aa  131  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 		 481 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  24.33 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 500 aa  113  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  24.01 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  23.19 
 
 		 465 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  24.08 
 
 		 489 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1975  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1067  inner membrane transporter YcaM  23.23 
 
 		 473 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.154382  normal  0.709783 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0973  inner membrane transporter YcaM  23.23 
 
 		 473 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1002  inner membrane transporter YcaM  23.23 
 
 		 473 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1082  inner membrane transporter YcaM  23.23 
 
 		 473 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1033  inner membrane transporter YcaM  23.23 
 
 		 473 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.843228 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002656  putative oxidoreductase  24.19 
 
 		 477 aa  96.3  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0976  amino acid permease family protein  22.62 
 
 		 540 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.953218  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1005  amino acid permease family protein  22.62 
 
 		 540 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1880  amino acid transporter  21.97 
 
 		 492 aa  88.2  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000114764  hitchhiker  0.000000000709791 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2220  amino acid permease family protein  22.73 
 
 		 476 aa  87  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52526 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00903  predicted transporter  22.5 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2744  amino acid permease-associated region  22.5 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2697  amino acid permease-associated region  22.5 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00910  hypothetical protein  22.5 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02947  predicted transporter  23.39 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0623  amino acid permease-associated region  23.39 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1062  amino acid permease family protein  22.5 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0622  amino acid permease-associated region  23.39 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3545  amino acid permease family protein  23.39 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3260  amino acid permease family protein  23.39 
 
 		 477 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4392  amino acid permease family protein  23.39 
 
 		 477 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3372  amino acid permease family protein  23.39 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  28.28 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  28.28 
 
 		 445 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  28.28 
 
 		 445 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  28.28 
 
 		 445 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  28.28 
 
 		 445 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  25.72 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  25.72 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  25.72 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  25.72 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  25.72 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  25.72 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  25.72 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  25.72 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 435 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>