More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_63480 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  100 
 
 		 465 aa  919    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  44.1 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  41.06 
 
 		 481 aa  331  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  36.67 
 
 		 467 aa  318  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  34.5 
 
 		 472 aa  258  1e-67  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  31.03 
 
 		 500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 		 455 aa  230  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  32.31 
 
 		 500 aa  222  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  29.82 
 
 		 497 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  25.48 
 
 		 464 aa  151  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  25.24 
 
 		 464 aa  151  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  25.56 
 
 		 473 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  25.56 
 
 		 473 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  25.56 
 
 		 473 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  25.56 
 
 		 473 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  25.4 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 499 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 		 469 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  22.83 
 
 		 467 aa  119  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  22.83 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  24.26 
 
 		 473 aa  117  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  25.82 
 
 		 508 aa  113  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 494 aa  110  4.0000000000000004e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  27.64 
 
 		 476 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  23.93 
 
 		 470 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 495 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  23.93 
 
 		 476 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  26.85 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  26.83 
 
 		 506 aa  97.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  23.26 
 
 		 474 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  23.26 
 
 		 474 aa  96.3  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  24.22 
 
 		 475 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 503 aa  92.8  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  23.13 
 
 		 475 aa  87.4  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00206  lysine/cadaverine antiporter  26.98 
 
 		 448 aa  87  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  23.77 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  21.82 
 
 		 489 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  24.04 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002188  lysine/cadaverine antiporter membrane protein CadB  26.98 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000189693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  28.85 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  22.03 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  21.14 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2759  lysine/cadaverine antiporter  24.6 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2821  lysine/cadaverine antiporter  24.6 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2717  lysine/cadaverine antiporter  24.6 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2800  lysine/cadaverine antiporter  24.6 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.1623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2934  lysine/cadaverine antiporter  24.6 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.252343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2492  lysine/cadaverine antiporter  26.98 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2217  amino acid permease-associated region  23.73 
 
 		 503 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1980  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2045  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1999  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0525134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3768  lysine/cadaverine antiporter  24.6 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000519797  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4373  lysine/cadaverine antiporter  25.5 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0915774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04003  predicted lysine/cadaverine transporter  25.5 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4687  lysine/cadaverine antiporter  25.5 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5648  lysine/cadaverine antiporter  25.5 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.742778  normal  0.745814 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03965  hypothetical protein  25.5 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4601  lysine/cadaverine antiporter  25.5 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000619747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3895  lysine/cadaverine antiporter  25.5 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2616  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923502  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2657  lysine/cadaverine antiporter  25.34 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  26.6 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  23.19 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  24.18 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  21.15 
 
 		 495 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  21.15 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4907  amino acid permease-associated region  22.41 
 
 		 459 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5379  amino acid permease-associated region  22.41 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0243202  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3459  amino acid permease-associated region  22.41 
 
 		 459 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  23.79 
 
 		 505 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0786  amino acid tranporter  22.28 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal  0.194759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0906  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1975  amino acid permease-associated region  23.5 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1447  amino acid permease-associated region  23.63 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2513  amino acid permease-associated region  22.69 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0665501  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2464  amino acid permease-associated region  22.69 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025431  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  25.07 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1458  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  22.57 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  20.14 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  22.06 
 
 		 511 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03339  hypothetical protein  22.6 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 441 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  22.06 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  22.06 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  22.06 
 
 		 511 aa  67  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  22.06 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  22.06 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  22.06 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  22.06 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  22.06 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1880  amino acid transporter  25.81 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000114764  hitchhiker  0.000000000709791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 460 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  26.4 
 
 		 456 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  21.27 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>