More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0708 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  100 
 
 
480 aa  949    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  43.55 
 
 
506 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  43.1 
 
 
506 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  43.04 
 
 
495 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  36.81 
 
 
467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  36.81 
 
 
467 aa  306  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  35.26 
 
 
464 aa  306  6e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  35.04 
 
 
464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  35.86 
 
 
494 aa  302  8.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  35.21 
 
 
466 aa  295  2e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  36.57 
 
 
508 aa  280  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  35.1 
 
 
499 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  34.6 
 
 
474 aa  269  8.999999999999999e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  34.6 
 
 
474 aa  269  1e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  32.37 
 
 
474 aa  266  5e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  33.92 
 
 
490 aa  266  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  35.75 
 
 
495 aa  260  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  33.48 
 
 
473 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  34.93 
 
 
473 aa  250  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  31.53 
 
 
469 aa  250  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  31.67 
 
 
472 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  31.42 
 
 
472 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  34.7 
 
 
473 aa  241  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  31.37 
 
 
476 aa  240  5e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  31.37 
 
 
470 aa  239  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  32.08 
 
 
485 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  32.89 
 
 
485 aa  236  8e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.69 
 
 
511 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.61 
 
 
511 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  30.61 
 
 
511 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  30.61 
 
 
511 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  30.61 
 
 
511 aa  234  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  30.61 
 
 
511 aa  234  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.61 
 
 
511 aa  234  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  31.03 
 
 
511 aa  234  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.61 
 
 
511 aa  234  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  30.15 
 
 
503 aa  223  6e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  30.32 
 
 
475 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  30.11 
 
 
475 aa  210  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  29.87 
 
 
511 aa  202  9.999999999999999e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  29.24 
 
 
720 aa  176  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  28.15 
 
 
494 aa  173  7.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  26.35 
 
 
473 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  26.35 
 
 
473 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  26.35 
 
 
473 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  26.35 
 
 
473 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  26.35 
 
 
473 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  25.91 
 
 
445 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  25.91 
 
 
445 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  27.11 
 
 
495 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  27.71 
 
 
464 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  26.89 
 
 
495 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  28.93 
 
 
497 aa  131  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  24.53 
 
 
472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  25.95 
 
 
455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 
481 aa  113  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 
500 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  27.06 
 
 
489 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  26.35 
 
 
489 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  23.81 
 
 
465 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002656  putative oxidoreductase  25.74 
 
 
477 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0622  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 
477 aa  100  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02947  predicted transporter  25.69 
 
 
477 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3260  amino acid permease family protein  25.69 
 
 
477 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3372  amino acid permease family protein  25.69 
 
 
477 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4392  amino acid permease family protein  25.69 
 
 
477 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3545  amino acid permease family protein  25.69 
 
 
477 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0623  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 
477 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1975  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 
496 aa  97.1  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 
500 aa  96.7  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1382  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 
501 aa  83.2  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.320464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03339  hypothetical protein  23.04 
 
 
476 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0828  amino acid transporter  25.41 
 
 
502 aa  80.9  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000137053  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1400  amino acid permease family protein  21.96 
 
 
498 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00116878  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  23.89 
 
 
467 aa  79  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3036  amino acid transporter  24.45 
 
 
464 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0805799  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1212  amino acid permease yshA  21.32 
 
 
498 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0367716  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1995  amino acid transporter  22.94 
 
 
507 aa  75.9  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0293042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1062  amino acid permease family protein  22.85 
 
 
476 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00903  predicted transporter  22.85 
 
 
476 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2697  amino acid permease-associated region  22.85 
 
 
476 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2744  amino acid permease-associated region  22.85 
 
 
476 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0976  amino acid permease family protein  22.85 
 
 
540 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.953218  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2220  amino acid permease family protein  23.19 
 
 
476 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.52526 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1005  amino acid permease family protein  22.85 
 
 
540 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00910  hypothetical protein  22.85 
 
 
476 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1082  inner membrane transporter YcaM  22.35 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224417  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1002  inner membrane transporter YcaM  22.35 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0973  inner membrane transporter YcaM  22.35 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1067  inner membrane transporter YcaM  22.35 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.154382  normal  0.709783 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1033  inner membrane transporter YcaM  22.35 
 
 
473 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.843228 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3834  amino acid permease-associated region  22.08 
 
 
514 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4627  amino acid permease family protein  22.14 
 
 
514 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.592733  normal  0.0531629 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3854  amino acid permease-associated region  22.08 
 
 
500 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04028  predicted transporter  22.08 
 
 
500 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.853032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5674  amino acid permease family protein  22.08 
 
 
514 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270283  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03990  hypothetical protein  22.08 
 
 
489 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.826607  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4400  amino acid permease family protein  22.08 
 
 
500 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4715  amino acid permease family protein  21.59 
 
 
500 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.212622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  24.94 
 
 
476 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>