272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1297 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  98.56 
 
 		 485 aa  948    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  100 
 
 		 485 aa  961    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  63.21 
 
 		 472 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  62.58 
 
 		 472 aa  586  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  62.31 
 
 		 503 aa  548  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  56.96 
 
 		 511 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  56.96 
 
 		 511 aa  522  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  56.96 
 
 		 511 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  56.96 
 
 		 511 aa  522  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  56.96 
 
 		 511 aa  522  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  56.96 
 
 		 511 aa  522  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  56.96 
 
 		 511 aa  522  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  56.96 
 
 		 511 aa  521  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  56.96 
 
 		 511 aa  521  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  50.32 
 
 		 720 aa  429  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  42.73 
 
 		 511 aa  355  6.999999999999999e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  39.02 
 
 		 494 aa  315  9.999999999999999e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  32.3 
 
 		 473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  32.46 
 
 		 480 aa  235  2.0000000000000002e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  31.38 
 
 		 467 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  31.38 
 
 		 467 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  33.62 
 
 		 494 aa  220  3.9999999999999997e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  29.67 
 
 		 464 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  29.91 
 
 		 464 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  30.8 
 
 		 499 aa  204  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  32.25 
 
 		 474 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  29.11 
 
 		 474 aa  200  6e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  29.11 
 
 		 474 aa  199  7e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  29.22 
 
 		 466 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  28.84 
 
 		 495 aa  189  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  28.81 
 
 		 508 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  27.76 
 
 		 473 aa  178  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  26.39 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  26.39 
 
 		 476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  30.64 
 
 		 469 aa  173  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  29.14 
 
 		 475 aa  172  9e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 490 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  27.53 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  29.57 
 
 		 475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  26.89 
 
 		 506 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  25.94 
 
 		 506 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  29.24 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0217  amino acid antiporter  31.91 
 
 		 782 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  25.22 
 
 		 473 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  25.22 
 
 		 473 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  25.22 
 
 		 473 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  25.22 
 
 		 473 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  25.22 
 
 		 473 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  25.33 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  25.33 
 
 		 445 aa  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  24.22 
 
 		 472 aa  106  9e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  21.27 
 
 		 495 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  21.27 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5194  putrescine transporter  23.29 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 497 aa  81.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  22.73 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6446  amino acid permease-associated region  23.43 
 
 		 750 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396159 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  22.1 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00903  predicted transporter  25.54 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2744  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2697  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0976  amino acid permease family protein  25.54 
 
 		 540 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.953218  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1005  amino acid permease family protein  25.54 
 
 		 540 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00910  hypothetical protein  25.54 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1062  amino acid permease family protein  25.54 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2220  amino acid permease family protein  25.06 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52526 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1226  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1382  amino acid permease-associated region  23.28 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.320464  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  23.57 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  20.53 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  23.47 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1082  inner membrane transporter YcaM  23.75 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1002  inner membrane transporter YcaM  23.75 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1067  inner membrane transporter YcaM  23.75 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.154382  normal  0.709783 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0973  inner membrane transporter YcaM  23.75 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  23.47 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  23.47 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  23.47 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  23.47 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1033  inner membrane transporter YcaM  23.75 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.843228 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  23.47 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  23.47 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  23.47 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  22.79 
 
 		 445 aa  67  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  23.53 
 
 		 500 aa  67  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  22.11 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  22.11 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  22.11 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  22.11 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  24.75 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2332  amino acid permease family protein  25.84 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  24.75 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  21.77 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  24.41 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1212  amino acid permease yshA  24.57 
 
 		 498 aa  63.5  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0367716  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1400  amino acid permease family protein  23.99 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00116878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2989  putrescine transporter  21.68 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00443871  normal  0.0573626 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1034  amino acid permease family protein  24.62 
 
 		 540 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.696759  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2046  amino acid permease family protein  24.49 
 
 		 496 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>