More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2342 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  100 
 
 
508 aa  988    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  76.72 
 
 
495 aa  698    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  55.08 
 
 
499 aa  545  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  51.97 
 
 
494 aa  503  1e-141  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  35.15 
 
 
473 aa  315  9e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  40.95 
 
 
469 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  37.78 
 
 
506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  37.5 
 
 
506 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  36.91 
 
 
467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  36.91 
 
 
467 aa  307  3e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  36.89 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  38.38 
 
 
464 aa  303  5.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  38.17 
 
 
464 aa  303  5.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  35.89 
 
 
495 aa  297  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  35.59 
 
 
490 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  37.04 
 
 
480 aa  281  1e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  34.34 
 
 
470 aa  268  1e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  34.34 
 
 
476 aa  268  1e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  34.12 
 
 
466 aa  256  9e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  32.4 
 
 
474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  32.4 
 
 
474 aa  255  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  32.76 
 
 
473 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  32.54 
 
 
473 aa  233  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  33.82 
 
 
472 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  33.4 
 
 
472 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  31.28 
 
 
503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  29.64 
 
 
473 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  29.64 
 
 
473 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  29.64 
 
 
473 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  29.64 
 
 
473 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  29.64 
 
 
473 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  32.49 
 
 
511 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  32.49 
 
 
511 aa  209  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  32.49 
 
 
511 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  32.49 
 
 
511 aa  209  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  32.49 
 
 
511 aa  209  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  32.49 
 
 
511 aa  209  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  32.49 
 
 
511 aa  209  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  32.49 
 
 
511 aa  209  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  32.18 
 
 
511 aa  208  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  29.33 
 
 
475 aa  203  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  33.81 
 
 
720 aa  199  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  29.03 
 
 
475 aa  197  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  29.01 
 
 
485 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  28.81 
 
 
485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  27.26 
 
 
511 aa  183  6e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  26.17 
 
 
494 aa  164  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  25.16 
 
 
445 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  24.84 
 
 
445 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  29.91 
 
 
481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 
464 aa  120  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  23.17 
 
 
472 aa  113  9e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 
497 aa  104  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 
455 aa  103  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 
500 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  24.17 
 
 
500 aa  97.4  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  27.03 
 
 
465 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  23.42 
 
 
489 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  22.79 
 
 
495 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1999  amino acid permease-associated region  24.18 
 
 
504 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0525134  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1980  amino acid permease-associated region  24.18 
 
 
504 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2045  amino acid permease-associated region  24.18 
 
 
504 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708803  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  23.31 
 
 
489 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  22.55 
 
 
495 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2217  amino acid permease-associated region  23.52 
 
 
503 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4126  amino acid permease-associated region  23.85 
 
 
502 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.635081  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1382  amino acid permease-associated region  23.46 
 
 
501 aa  76.3  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.320464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  25.64 
 
 
476 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1226  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 
497 aa  75.1  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  27.59 
 
 
446 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  24 
 
 
468 aa  73.9  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  27.64 
 
 
483 aa  73.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4763  inner membrane transporter YjeM  22.88 
 
 
500 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.520052 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4615  inner membrane transporter YjeM  22.88 
 
 
500 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4623  inner membrane transporter YjeM  22.88 
 
 
500 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4706  inner membrane transporter YjeM  22.88 
 
 
500 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.929482  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  22.85 
 
 
467 aa  71.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4742  inner membrane transporter YjeM  22.7 
 
 
493 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4627  amino acid permease family protein  23.02 
 
 
514 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.592733  normal  0.0531629 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4715  amino acid permease family protein  23.2 
 
 
500 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.212622  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3834  amino acid permease-associated region  22.61 
 
 
514 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  23.72 
 
 
487 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5674  amino acid permease family protein  23.26 
 
 
514 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270283  normal  0.215143 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04028  predicted transporter  23.26 
 
 
500 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.853032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3854  amino acid permease-associated region  22.38 
 
 
500 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4400  amino acid permease family protein  23.26 
 
 
500 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03990  hypothetical protein  23.26 
 
 
489 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.826607  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 
503 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0828  amino acid transporter  24.68 
 
 
502 aa  66.6  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000137053  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3885  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 
487 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1223  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 
490 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1975  amino acid permease-associated region  21.94 
 
 
496 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 
516 aa  65.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  23.18 
 
 
468 aa  65.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  23.43 
 
 
471 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 
475 aa  65.1  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1820  amino acid permease-associated region  22.34 
 
 
486 aa  65.1  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1880  amino acid transporter  21.22 
 
 
492 aa  63.9  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000114764  hitchhiker  0.000000000709791 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  24.54 
 
 
466 aa  63.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1448  amino acid permease-associated region  23 
 
 
473 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>