More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3446 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 455 aa  895    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  58.3 
 
 		 500 aa  497  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  52.98 
 
 		 500 aa  478  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  56.86 
 
 		 497 aa  474  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  37.42 
 
 		 464 aa  307  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  36.08 
 
 		 481 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  34.75 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  32.77 
 
 		 467 aa  223  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  29.33 
 
 		 465 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  27.76 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  27.52 
 
 		 464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 474 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  27.39 
 
 		 473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  26.77 
 
 		 467 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  26.77 
 
 		 467 aa  126  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 499 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 		 469 aa  117  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 495 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  24.6 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  24.6 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 480 aa  114  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  26.77 
 
 		 466 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  25.69 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  25.69 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  23.51 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  23.51 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  23.51 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  23.51 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  22.86 
 
 		 473 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  24.06 
 
 		 475 aa  106  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  23.1 
 
 		 494 aa  106  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  24.33 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 508 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  25.86 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  26.39 
 
 		 506 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  24.36 
 
 		 473 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  24.36 
 
 		 473 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2217  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 		 503 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2045  amino acid permease-associated region  22.32 
 
 		 504 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1980  amino acid permease-associated region  22.32 
 
 		 504 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1999  amino acid permease-associated region  22.32 
 
 		 504 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0525134  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 452 aa  93.6  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 495 aa  93.2  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 447 aa  93.2  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  26.25 
 
 		 472 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4126  amino acid permease-associated region  22.73 
 
 		 502 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.635081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  24.59 
 
 		 511 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  24.59 
 
 		 511 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  24.59 
 
 		 511 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  24.59 
 
 		 511 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  24.59 
 
 		 511 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  24.59 
 
 		 511 aa  89.7  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  24.59 
 
 		 511 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  24.59 
 
 		 511 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  24.59 
 
 		 511 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 490 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  23.24 
 
 		 511 aa  89.7  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  26.02 
 
 		 489 aa  87  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  26.25 
 
 		 472 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  25.58 
 
 		 489 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  25.42 
 
 		 495 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  23.02 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  25.18 
 
 		 495 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  25.87 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  24.52 
 
 		 503 aa  80.1  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  26.91 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  26.91 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  25.87 
 
 		 485 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  26.91 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1695  amino acid transporter  23.76 
 
 		 480 aa  77  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00330646  decreased coverage  1.25344e-25 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  25.07 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  26.99 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  26.99 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  26.99 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  26.99 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6446  amino acid permease-associated region  29.88 
 
 		 750 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396159 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  26.99 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  26.99 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  26.99 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  26.99 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  26.99 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  24.73 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  24.73 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  24.73 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  24.73 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  24.45 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04834  putrescine transporter  23.01 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  21.62 
 
 		 494 aa  72.8  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1311  amino acid transporter  23.04 
 
 		 516 aa  73.2  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5194  putrescine transporter  30.19 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1880  amino acid transporter  26.89 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000114764  hitchhiker  0.000000000709791 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001093  putrescine/proton symporter putrescine/ornithine antiporter PotE  21.68 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  22.43 
 
 		 720 aa  71.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  23.62 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2220  amino acid permease family protein  23 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52526 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2697  amino acid permease-associated region  23.2 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1005  amino acid permease family protein  23.2 
 
 		 540 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  22.5 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3036  amino acid transporter  25.4 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0805799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>