More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2318 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 469 aa  895    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  46.56 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  37.44 
 
 		 467 aa  349  6e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  37.44 
 
 		 467 aa  348  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  38.51 
 
 		 474 aa  332  8e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  38.51 
 
 		 474 aa  332  1e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  37.15 
 
 		 494 aa  331  1e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  40.64 
 
 		 508 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  34.63 
 
 		 473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  38.38 
 
 		 476 aa  313  3.9999999999999997e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  38.38 
 
 		 470 aa  313  4.999999999999999e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  35.54 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  35.32 
 
 		 464 aa  307  3e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  36.15 
 
 		 495 aa  292  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  33.05 
 
 		 473 aa  283  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  36.42 
 
 		 499 aa  280  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  38.15 
 
 		 495 aa  280  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  32.6 
 
 		 466 aa  270  4e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  33.26 
 
 		 473 aa  269  8e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  34.8 
 
 		 490 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  34.11 
 
 		 506 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  34.42 
 
 		 475 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  33.41 
 
 		 506 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  31.86 
 
 		 480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  34.35 
 
 		 475 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  29.04 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  29.04 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  29.04 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  29.04 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  29.04 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  29.05 
 
 		 445 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  28.61 
 
 		 503 aa  205  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  28.83 
 
 		 445 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  29.41 
 
 		 511 aa  202  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  29.54 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  29.54 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  29.54 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  29.54 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  29.54 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  29.54 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  29.54 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  29.72 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  29.33 
 
 		 472 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  29.11 
 
 		 472 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  30.68 
 
 		 485 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  30.24 
 
 		 485 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 720 aa  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  24.68 
 
 		 511 aa  147  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  25.69 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  23.72 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  28.41 
 
 		 465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  25.51 
 
 		 476 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 497 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 		 500 aa  91.3  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  24.08 
 
 		 500 aa  91.3  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  22.28 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  23.38 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2217  amino acid permease-associated region  27.96 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1980  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 504 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1999  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 504 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0525134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2045  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 504 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  23.12 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4126  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.635081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1880  amino acid transporter  20.5 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000114764  hitchhiker  0.000000000709791 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  26.94 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  26.05 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  26.84 
 
 		 482 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  27.2 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  26.6 
 
 		 482 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4275  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5194  putrescine transporter  27.63 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1695  amino acid transporter  22.44 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00330646  decreased coverage  1.25344e-25 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  27.45 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  22.98 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0539  amino acid permease-associated region  24.44 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  31.07 
 
 		 486 aa  67  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  26.98 
 
 		 474 aa  66.6  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1067  inner membrane transporter YcaM  22.35 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.154382  normal  0.709783 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1002  inner membrane transporter YcaM  22.35 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1082  inner membrane transporter YcaM  22.35 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1033  inner membrane transporter YcaM  22.35 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.843228 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  25.74 
 
 		 531 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0973  inner membrane transporter YcaM  22.35 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  20.17 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  24.05 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  28.39 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  26.82 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  27.49 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  24.7 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  25.46 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>