More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3825 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  100 
 
 		 506 aa  992    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  94.27 
 
 		 506 aa  921    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  42.28 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  43.82 
 
 		 480 aa  411  1e-113  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  41.86 
 
 		 494 aa  343  2.9999999999999997e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  37.26 
 
 		 499 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  37.95 
 
 		 508 aa  313  4.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  38.3 
 
 		 473 aa  300  4e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  36.5 
 
 		 467 aa  299  7e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  36.5 
 
 		 467 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  35.15 
 
 		 464 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  35.15 
 
 		 464 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  33.9 
 
 		 474 aa  277  3e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  33.9 
 
 		 474 aa  277  3e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  34.18 
 
 		 474 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  36.67 
 
 		 495 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  31.61 
 
 		 466 aa  265  2e-69  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  34.01 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  33.97 
 
 		 473 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  34.39 
 
 		 473 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  30.87 
 
 		 476 aa  231  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  30.87 
 
 		 470 aa  230  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  34.83 
 
 		 490 aa  229  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  27.44 
 
 		 503 aa  210  4e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  29.77 
 
 		 472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  28.07 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  28.07 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  28.07 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.07 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  28.07 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.07 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.07 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.07 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.07 
 
 		 511 aa  196  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  29.41 
 
 		 472 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  30.25 
 
 		 473 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  30.25 
 
 		 473 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  30.25 
 
 		 473 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  30.25 
 
 		 473 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  29.83 
 
 		 473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  27.57 
 
 		 511 aa  180  4.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  28.35 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  30.57 
 
 		 720 aa  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  27.12 
 
 		 485 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  27.9 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  26.89 
 
 		 485 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  27.51 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  27.29 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  25.25 
 
 		 494 aa  126  7e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  28.98 
 
 		 481 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 464 aa  114  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 		 497 aa  113  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  27.13 
 
 		 500 aa  104  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  23.7 
 
 		 472 aa  103  8e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 		 500 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  23.76 
 
 		 495 aa  94.7  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  23.76 
 
 		 495 aa  94.4  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  26.56 
 
 		 465 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  24.66 
 
 		 489 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  23.32 
 
 		 489 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  26.46 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1995  amino acid transporter  24.79 
 
 		 507 aa  72.8  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0293042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  25.93 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1980  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1999  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0525134  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0542  gamma-aminobutyrate permease or related permease  24.32 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000937541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2045  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002656  putative oxidoreductase  23.72 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1059  phenylalanine transporter  24.79 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  24.87 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 503 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  23.01 
 
 		 528 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0828  amino acid transporter  21.17 
 
 		 502 aa  63.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000137053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  23.34 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  22.92 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  22.92 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  23.34 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  22.92 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2217  amino acid permease-associated region  22.82 
 
 		 503 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  23.34 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  22.92 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0623  phenylalanine transporter  24.44 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0943118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  23.12 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  23.12 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  23.12 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  23.12 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  22.67 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  23.12 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  23.12 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  23.12 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  23.12 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00537  phenylalanine transporter  24.44 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00526  hypothetical protein  24.44 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1034  amino acid permease family protein  21.25 
 
 		 540 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.696759  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  22.92 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0594  phenylalanine transporter  24.44 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0594  phenylalanine transporter  24.44 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.454121  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0657  phenylalanine transporter  24.44 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>