83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0217 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0217  amino acid antiporter  100 
 
 
782 aa  1605    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  31.37 
 
 
511 aa  153  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  31.37 
 
 
511 aa  153  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  31.37 
 
 
511 aa  153  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  31.37 
 
 
511 aa  153  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  31.37 
 
 
511 aa  153  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  31.37 
 
 
511 aa  153  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  31.37 
 
 
511 aa  153  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  31.37 
 
 
511 aa  153  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  31.37 
 
 
511 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  31.19 
 
 
472 aa  147  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  31.58 
 
 
472 aa  146  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  31.53 
 
 
485 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  31.53 
 
 
485 aa  145  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  30.03 
 
 
511 aa  133  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  31.8 
 
 
503 aa  133  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  29.43 
 
 
720 aa  115  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  28.39 
 
 
473 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  25.78 
 
 
494 aa  103  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  26.03 
 
 
464 aa  87.4  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  26.67 
 
 
464 aa  87  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 
474 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  24.41 
 
 
466 aa  86.7  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  24.51 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  24.51 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 
490 aa  77.4  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  22.8 
 
 
495 aa  76.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  24.26 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  24.26 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  25.27 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  25.4 
 
 
473 aa  73.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  25.4 
 
 
473 aa  73.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  24.37 
 
 
475 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04028  predicted transporter  24.18 
 
 
500 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.853032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4627  amino acid permease family protein  24.18 
 
 
514 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.592733  normal  0.0531629 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3834  amino acid permease-associated region  24.18 
 
 
514 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4400  amino acid permease family protein  24.18 
 
 
500 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5674  amino acid permease family protein  24.18 
 
 
514 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270283  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3854  amino acid permease-associated region  24.18 
 
 
500 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03990  hypothetical protein  24.18 
 
 
489 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.826607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4715  amino acid permease family protein  24.18 
 
 
500 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.212622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  24.6 
 
 
473 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  24.92 
 
 
473 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  24.92 
 
 
473 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  24.92 
 
 
473 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  24.92 
 
 
473 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0828  amino acid transporter  26.35 
 
 
502 aa  68.9  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000137053  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  23.84 
 
 
494 aa  67.4  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 
508 aa  66.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  23.47 
 
 
499 aa  65.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4623  inner membrane transporter YjeM  23.83 
 
 
500 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4615  inner membrane transporter YjeM  23.83 
 
 
500 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4763  inner membrane transporter YjeM  23.83 
 
 
500 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.520052 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4706  inner membrane transporter YjeM  23.83 
 
 
500 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.929482  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 
480 aa  64.7  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  23.23 
 
 
472 aa  60.1  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  23.1 
 
 
495 aa  60.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4742  inner membrane transporter YjeM  23.27 
 
 
493 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  19.82 
 
 
469 aa  55.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  21.9 
 
 
506 aa  53.5  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  24.43 
 
 
489 aa  53.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  23.87 
 
 
445 aa  52.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  21.94 
 
 
506 aa  52.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  23.87 
 
 
445 aa  51.2  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  31.46 
 
 
476 aa  50.4  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  31.46 
 
 
470 aa  50.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0973  inner membrane transporter YcaM  21.32 
 
 
473 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1002  inner membrane transporter YcaM  21.32 
 
 
473 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1082  inner membrane transporter YcaM  21.32 
 
 
473 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224417  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1067  inner membrane transporter YcaM  21.32 
 
 
473 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.154382  normal  0.709783 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1033  inner membrane transporter YcaM  21.32 
 
 
473 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.843228 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  23.99 
 
 
489 aa  47  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1034  amino acid permease family protein  22.46 
 
 
540 aa  47  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.696759  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1062  amino acid permease family protein  21.09 
 
 
476 aa  45.8  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2697  amino acid permease-associated region  21.09 
 
 
476 aa  45.8  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00910  hypothetical protein  21.09 
 
 
476 aa  45.8  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00903  predicted transporter  21.09 
 
 
476 aa  45.8  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2744  amino acid permease-associated region  21.09 
 
 
476 aa  45.8  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397041  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2220  amino acid permease family protein  21.09 
 
 
476 aa  46.2  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.52526 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1005  amino acid permease family protein  21.32 
 
 
540 aa  45.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0976  amino acid permease family protein  21.32 
 
 
540 aa  45.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.953218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1217  amino acid permease family protein  21.8 
 
 
540 aa  44.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0249423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1212  amino acid permease yshA  29.67 
 
 
498 aa  44.3  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0367716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>