45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_45036 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_45036  high affinity methionine permease  100 
 
 		 522 aa  1038    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.245416  normal  0.788743 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09490  methionine transporter (Eurofung)  42.6 
 
 		 510 aa  404  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.769842 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00310  high-affinity methionine permease, putative  37.74 
 
 		 582 aa  329  8e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01631  methionine transporter (Eurofung)  35.76 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.281549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69488  high affinity methionine permease  34.7 
 
 		 551 aa  275  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.649926  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02560  methionine transporter, putative (Eurofung)  30.97 
 
 		 560 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.503958 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07243  methionine transporter, putative (Eurofung)  29.16 
 
 		 557 aa  177  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.366956  normal  0.430438 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28954  very low affinity methionine permease  26.76 
 
 		 550 aa  155  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144807  normal  0.597745 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10319  amino acid transporter (Eurofung)  28.64 
 
 		 514 aa  143  9e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204416  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09379  amino acid transporter, partial (Eurofung)  38.18 
 
 		 184 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0862011 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_11329  methionine permease  25.37 
 
 		 459 aa  136  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.408127 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09300  amino acid transporter (Eurofung)  23.6 
 
 		 614 aa  90.1  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.917977  normal  0.922161 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  23.95 
 
 		 609 aa  63.5  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  30.08 
 
 		 580 aa  62.4  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  24.86 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 		 467 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 482 aa  53.9  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  24.11 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2592  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 452 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000351303  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  27.5 
 
 		 452 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  28.57 
 
 		 473 aa  50.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  23.66 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  23.66 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  23.66 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  30.68 
 
 		 485 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  23.44 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  23.57 
 
 		 453 aa  47.8  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  21.12 
 
 		 489 aa  47.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  23.44 
 
 		 438 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  23.44 
 
 		 438 aa  47  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  23.44 
 
 		 438 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  22.97 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1095  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.212668  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  23.02 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  22.68 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  25.51 
 
 		 440 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 		 457 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  24.1 
 
 		 452 aa  43.5  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  27.13 
 
 		 447 aa  43.5  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 463 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>