52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3248 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  49.94 
 
 		 2454 aa  641    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  49.94 
 
 		 2421 aa  644    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  100 
 
 		 953 aa  1888    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  43.47 
 
 		 2411 aa  550  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  43.47 
 
 		 2367 aa  550  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  44.21 
 
 		 2807 aa  540  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  40.6 
 
 		 976 aa  503  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  42.28 
 
 		 750 aa  183  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  29.03 
 
 		 2772 aa  162  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  31.01 
 
 		 1976 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1059 aa  117  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  32.41 
 
 		 1079 aa  115  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3077  hypothetical protein  30.96 
 
 		 673 aa  110  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  30.63 
 
 		 1223 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  26.72 
 
 		 3793 aa  96.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  35.66 
 
 		 4978 aa  93.6  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1329 aa  92  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  29.92 
 
 		 2418 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  30.61 
 
 		 2416 aa  80.9  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1969 aa  80.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  29.9 
 
 		 1987 aa  79  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1259 aa  77.8  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1648  hypothetical protein  39.78 
 
 		 707 aa  75.1  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255436  normal  0.0205712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  27.7 
 
 		 1527 aa  71.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  26.61 
 
 		 2713 aa  70.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  34.1 
 
 		 1507 aa  67  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  33.91 
 
 		 4071 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  30.18 
 
 		 1657 aa  64.7  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  27.7 
 
 		 1750 aa  61.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  36.24 
 
 		 4896 aa  59.7  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  32.64 
 
 		 1288 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  26.82 
 
 		 3542 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  34.76 
 
 		 14944 aa  55.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  37.61 
 
 		 2833 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  27.19 
 
 		 2262 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.24 
 
 		 1343 aa  51.6  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0803  hypothetical protein  34.31 
 
 		 1114 aa  51.2  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0808  D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin  27.75 
 
 		 1436 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  27.33 
 
 		 2270 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  31.76 
 
 		 3608 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  33.66 
 
 		 1295 aa  48.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  30.59 
 
 		 3619 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  30.68 
 
 		 815 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2076  YD repeat protein  39.77 
 
 		 1740 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  30.59 
 
 		 3619 aa  47  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  25.57 
 
 		 2345 aa  46.2  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  26.98 
 
 		 1452 aa  46.2  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  36.96 
 
 		 1108 aa  45.8  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.72 
 
 		 1607 aa  45.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  23.83 
 
 		 1247 aa  45.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  45.61 
 
 		 915 aa  45.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  32.37 
 
 		 1132 aa  45.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>