59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2668 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2668  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  35.48 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  40.29 
 
 		 207 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 208 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 		 216 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  37.16 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 194 aa  89.4  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 143 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 166 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 129 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 137 aa  52.8  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 150 aa  52  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 296 aa  52  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  26.62 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  33.71 
 
 		 301 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 151 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 145 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 150 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  32.47 
 
 		 127 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 		 161 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  25.38 
 
 		 149 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 314 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 149 aa  45.4  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 139 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  27.96 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 161 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 138 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0523  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 187 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 137 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 		 154 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  22.96 
 
 		 140 aa  42.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 228 aa  43.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 141 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  34.88 
 
 		 343 aa  42.7  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  30.51 
 
 		 153 aa  42.7  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 143 aa  42.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 140 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  24 
 
 		 577 aa  42.4  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 140 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  21.9 
 
 		 147 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 140 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 134 aa  42  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1059  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 		 156 aa  42.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.891979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2080  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 190 aa  42.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.397171  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  27.93 
 
 		 142 aa  42.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 		 536 aa  42.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 		 130 aa  42  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 		 130 aa  42  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  27.43 
 
 		 135 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 153 aa  42  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  29.63 
 
 		 314 aa  42  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>