More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0527 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  100 
 
 		 414 aa  823    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  60.42 
 
 		 430 aa  513  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  59.95 
 
 		 430 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  57.41 
 
 		 426 aa  476  1e-133  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  50.47 
 
 		 430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  52.33 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  52.09 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  51.63 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  38.69 
 
 		 429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  37.3 
 
 		 429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  37.3 
 
 		 429 aa  302  8.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 		 430 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  37.67 
 
 		 430 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.39 
 
 		 418 aa  270  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  36.41 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  35.28 
 
 		 425 aa  246  6.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  34.16 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2135  lipoprotein ABC transporter permease  36.18 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.142253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  29.44 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  27.03 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  24.07 
 
 		 393 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  25.12 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  25.12 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  26.17 
 
 		 380 aa  124  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  28.47 
 
 		 371 aa  123  8e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  24.41 
 
 		 379 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  24.41 
 
 		 379 aa  119  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  29.27 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  25.47 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  27 
 
 		 372 aa  112  9e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  23.72 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  26.76 
 
 		 372 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  26.46 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  26.39 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  25.63 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  25.71 
 
 		 386 aa  91.3  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 386 aa  90.5  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  25.61 
 
 		 386 aa  88.2  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  24.72 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  24.1 
 
 		 455 aa  87.8  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  25.14 
 
 		 386 aa  87  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  22.55 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  23.39 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  23.72 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  21.63 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  22.33 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.91 
 
 		 646 aa  70.1  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  22.9 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.86 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  25.79 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  29.41 
 
 		 657 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  28.57 
 
 		 653 aa  68.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  24.43 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  25.33 
 
 		 488 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  23.31 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  23.88 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1983  protein of unknown function DUF214  28.11 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  31.43 
 
 		 658 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  21.62 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  21.7 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  23.78 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  35.25 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  25.92 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.69 
 
 		 648 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.33 
 
 		 648 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.33 
 
 		 648 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.19 
 
 		 648 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.33 
 
 		 648 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.33 
 
 		 648 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  23.04 
 
 		 643 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.07 
 
 		 648 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  22.42 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  31.03 
 
 		 644 aa  63.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  23.94 
 
 		 648 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  23.94 
 
 		 648 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  22.14 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  25.77 
 
 		 687 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  30.28 
 
 		 656 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  29.7 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  22.33 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  23.94 
 
 		 648 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.94 
 
 		 648 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  23.65 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.94 
 
 		 648 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  27.93 
 
 		 647 aa  62.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  23.43 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  34.13 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  22.22 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  25.77 
 
 		 681 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.93 
 
 		 648 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  25.77 
 
 		 681 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  31.76 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  32.52 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  33.08 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  36.67 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  34.96 
 
 		 651 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.94 
 
 		 648 aa  61.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  32.37 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3413  hypothetical protein  25.77 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  34.13 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>