More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1134 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1134  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0125  hypothetical protein  74.41 
 
 
212 aa  331  4e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0608  hypothetical protein  65.13 
 
 
215 aa  265  2.9999999999999995e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0859  hypothetical protein  64.53 
 
 
205 aa  263  1e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0742  hypothetical protein  53.43 
 
 
210 aa  223  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.14664  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0819  hypothetical protein  53.43 
 
 
210 aa  222  3e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0749  hypothetical protein  52.15 
 
 
205 aa  221  4.9999999999999996e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0140325  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1287  hypothetical protein  52.45 
 
 
210 aa  219  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.472331  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1235  hypothetical protein  54.59 
 
 
224 aa  216  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1062  alanine racemase domain protein  54.59 
 
 
225 aa  216  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  37.2 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  38.42 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  35.44 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  36.92 
 
 
219 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  38.35 
 
 
229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  35.47 
 
 
235 aa  123  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  35.64 
 
 
225 aa  121  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  37.81 
 
 
235 aa  121  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  35.75 
 
 
220 aa  121  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  37.56 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  31.34 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  36.45 
 
 
219 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0159  alanine racemase domain protein  38.1 
 
 
231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00156899  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  34.33 
 
 
227 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  34.83 
 
 
223 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  34.33 
 
 
231 aa  118  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_002936  DET0758  hypothetical protein  31.78 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  36.23 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  35.37 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  36.41 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  36.18 
 
 
224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  35.96 
 
 
236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48387  predicted protein  36.17 
 
 
250 aa  116  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.181338 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  35.92 
 
 
239 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  35.92 
 
 
232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0685  alanine racemase domain-containing protein  31.78 
 
 
220 aa  115  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.268017  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  33.63 
 
 
233 aa  115  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  33.96 
 
 
219 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 
213 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  33.18 
 
 
246 aa  114  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  35.24 
 
 
227 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  34.29 
 
 
226 aa  114  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  32.86 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  32.74 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  35.92 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  35.68 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  31.68 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  33.98 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  36.84 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01490  conserved hypothetical protein  34.91 
 
 
259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  34.13 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  35.47 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  36.36 
 
 
238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  35.78 
 
 
219 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  36.63 
 
 
224 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  35.58 
 
 
229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  34.48 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  33.5 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  31.68 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  33.84 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  32 
 
 
231 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  35.07 
 
 
229 aa  109  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  33.99 
 
 
228 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40339  predicted protein  33.65 
 
 
237 aa  108  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 
223 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0088  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  33.94 
 
 
266 aa  107  9.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154646 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  33.19 
 
 
229 aa  107  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  34.47 
 
 
230 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  30.74 
 
 
253 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  35.58 
 
 
237 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04561  TIM-barrel fold family protein  34.5 
 
 
212 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.618562  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  36.1 
 
 
248 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  35.98 
 
 
228 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  34.47 
 
 
242 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  34.63 
 
 
230 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  36.32 
 
 
225 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  29.7 
 
 
234 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  32.29 
 
 
237 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  34.65 
 
 
237 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  31.34 
 
 
218 aa  105  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  34.93 
 
 
238 aa  105  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  33.66 
 
 
242 aa  105  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  33.5 
 
 
247 aa  105  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  34.34 
 
 
247 aa  104  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1178  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 
255 aa  104  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  normal  0.161066 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  31.7 
 
 
230 aa  104  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  34.34 
 
 
247 aa  104  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  31.84 
 
 
237 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  31 
 
 
235 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01992  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  34.85 
 
 
239 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04141  TIM-barrel fold family protein  33.49 
 
 
211 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  32.02 
 
 
241 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  31.6 
 
 
239 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0390  hypothetical protein  32.87 
 
 
211 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.250945  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  32.2 
 
 
232 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>