227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0815 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0815  iron ABC transporter, solute-binding protein  100 
 
 
337 aa  682    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1285  periplasmic binding protein  67.06 
 
 
337 aa  461  1e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000393821  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10530  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.29 
 
 
376 aa  194  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  32.93 
 
 
393 aa  162  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  30.99 
 
 
358 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  30.25 
 
 
358 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  32.34 
 
 
337 aa  157  3e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  32.55 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  27.94 
 
 
360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  30.09 
 
 
360 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  28.89 
 
 
345 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  30.18 
 
 
362 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  27.27 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  27.3 
 
 
361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27.81 
 
 
374 aa  137  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  30.45 
 
 
341 aa  136  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.97 
 
 
386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  27.33 
 
 
353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  26.81 
 
 
353 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  27.24 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  25.8 
 
 
349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.02 
 
 
372 aa  117  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  27.78 
 
 
351 aa  116  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.4 
 
 
351 aa  114  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  28.14 
 
 
334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  27.56 
 
 
345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2805  periplasmic binding protein  26.88 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000505659  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  26.63 
 
 
363 aa  109  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  28.35 
 
 
351 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0530  periplasmic binding protein  27.08 
 
 
342 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.519305  normal  0.848906 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  26.04 
 
 
369 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2073  periplasmic binding protein  25.86 
 
 
343 aa  105  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1544  periplasmic binding protein  25.75 
 
 
360 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2004  putative ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  24.61 
 
 
354 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00731234  normal  0.178178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  24.78 
 
 
343 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1479  iron(III) dicitrate-biding protein  21.56 
 
 
360 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808536  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  25.9 
 
 
353 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  32.45 
 
 
378 aa  99.4  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  27.43 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  26.32 
 
 
344 aa  97.8  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  25.66 
 
 
354 aa  96.7  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  25.75 
 
 
350 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.07 
 
 
349 aa  95.9  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  25.75 
 
 
350 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  25.75 
 
 
350 aa  95.9  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  25.46 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  25.3 
 
 
350 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  25.38 
 
 
354 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  24.12 
 
 
349 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  33.33 
 
 
370 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  25.41 
 
 
682 aa  94  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  32.64 
 
 
366 aa  93.6  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  25.08 
 
 
682 aa  94  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  33.33 
 
 
365 aa  93.6  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  22.58 
 
 
397 aa  92.4  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  27.02 
 
 
483 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  28.7 
 
 
376 aa  90.1  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1203  putative periplasmic iron siderophore binding protein of ABC transporter  29.41 
 
 
347 aa  90.5  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  26.27 
 
 
375 aa  89.7  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  27.42 
 
 
360 aa  89.7  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  26.27 
 
 
378 aa  89.4  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  25.16 
 
 
348 aa  89.4  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  22.41 
 
 
354 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  24.29 
 
 
361 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  25.22 
 
 
362 aa  87.4  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  23.56 
 
 
363 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  22.19 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  27.73 
 
 
478 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  24.71 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  27.47 
 
 
346 aa  82.4  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.19 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  24.63 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  23.89 
 
 
348 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  22.49 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  24.5 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  25.45 
 
 
353 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  21.89 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  24.25 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  27.09 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  26.22 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  29.02 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  28.67 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  26.68 
 
 
352 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39880  periplasmic solute-binding component of iron(III) ABC transporter  24.23 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  35.51 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  20 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  24.33 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  26.09 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  23.58 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1157  periplasmic binding protein  31.25 
 
 
104 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  28.35 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  25.15 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  21.56 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  23.31 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  27.97 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  27.97 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0603  periplasmic binding protein  31.03 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  24.4 
 
 
343 aa  67  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1515  periplasmic binding protein  21.95 
 
 
345 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  22.03 
 
 
371 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.543354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>