More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03095 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03095  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  751    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  39.26 
 
 
442 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  39.68 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  38.33 
 
 
343 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  37.69 
 
 
1033 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  38.33 
 
 
343 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  33.58 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  36.96 
 
 
449 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  41.41 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  34.31 
 
 
216 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  26.8 
 
 
456 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  36.67 
 
 
204 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  35.96 
 
 
215 aa  64.7  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  33.07 
 
 
727 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  36.69 
 
 
333 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  36.28 
 
 
332 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  34.38 
 
 
309 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  36.44 
 
 
408 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  34 
 
 
267 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 
540 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  35.04 
 
 
181 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  31.01 
 
 
521 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  29.78 
 
 
206 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  33.06 
 
 
386 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  35.54 
 
 
175 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  31.67 
 
 
976 aa  62  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  33.07 
 
 
420 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  36.59 
 
 
418 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  34.11 
 
 
745 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  37.11 
 
 
416 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  32.08 
 
 
412 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  38.55 
 
 
447 aa  60.8  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  37.11 
 
 
961 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  30.63 
 
 
319 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  37.61 
 
 
493 aa  60.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  28.89 
 
 
312 aa  60.1  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  30.43 
 
 
706 aa  60.1  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  33.62 
 
 
176 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0745  pentapeptide repeat protein  29.51 
 
 
971 aa  60.1  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.888113  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  33.62 
 
 
176 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  29.93 
 
 
576 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
524 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  32.77 
 
 
254 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  31.97 
 
 
311 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 
351 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  31.65 
 
 
710 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  32.84 
 
 
389 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.6 
 
 
14916 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  36.59 
 
 
180 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  28 
 
 
452 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  33.83 
 
 
533 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2588  pentapeptide repeat-containing protein  40.45 
 
 
162 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  31.58 
 
 
600 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.14 
 
 
525 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  33.94 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  30.47 
 
 
184 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.15 
 
 
1831 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  34.75 
 
 
291 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  32.52 
 
 
315 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  29.03 
 
 
327 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  34.75 
 
 
291 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  32.89 
 
 
517 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  35.78 
 
 
210 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  37.76 
 
 
184 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  31.15 
 
 
245 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  26.39 
 
 
537 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2272  pentapeptide repeat-containing protein  41.76 
 
 
681 aa  57.4  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  35.65 
 
 
168 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  34.96 
 
 
420 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  33.82 
 
 
277 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  33.9 
 
 
433 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  32.46 
 
 
567 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  29.71 
 
 
900 aa  56.6  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  31.71 
 
 
315 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  33.59 
 
 
441 aa  56.6  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  33.61 
 
 
215 aa  56.2  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  36.67 
 
 
489 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  32.03 
 
 
293 aa  56.2  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  34.38 
 
 
286 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  39.33 
 
 
447 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  32.43 
 
 
563 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1294  serine/threonine protein kinase  35.24 
 
 
522 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
190 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  35.48 
 
 
448 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  31.3 
 
 
163 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  31.3 
 
 
452 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  32.23 
 
 
199 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  32.64 
 
 
165 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  28.19 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27891  hypothetical protein  35.45 
 
 
288 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  32.43 
 
 
563 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  31.37 
 
 
234 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  28.21 
 
 
776 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  30.97 
 
 
213 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  33.05 
 
 
294 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  37.86 
 
 
222 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  29.7 
 
 
825 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  30.97 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  32.23 
 
 
199 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  34.91 
 
 
205 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>