145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0977 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  100 
 
 
286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  79.93 
 
 
289 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  75 
 
 
286 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  40.58 
 
 
289 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  42.8 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  40.81 
 
 
306 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  38.77 
 
 
289 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  38.41 
 
 
289 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  41.44 
 
 
286 aa  201  9e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  40.49 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  39.27 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  38.29 
 
 
275 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  40.07 
 
 
312 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  36.46 
 
 
296 aa  198  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  39.34 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  39.42 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  38.97 
 
 
310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  38.97 
 
 
310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  36.23 
 
 
283 aa  195  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  38.6 
 
 
310 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  39.34 
 
 
312 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  39.1 
 
 
311 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  39.08 
 
 
295 aa  191  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  37.59 
 
 
287 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  38.95 
 
 
320 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  38.1 
 
 
304 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  37.22 
 
 
282 aa  185  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  36.13 
 
 
287 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  37.41 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  37.41 
 
 
290 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  36.75 
 
 
289 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  34.88 
 
 
290 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  36.94 
 
 
300 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  35.74 
 
 
296 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  37.32 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  36.88 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  36.84 
 
 
296 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  36.56 
 
 
296 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  38.2 
 
 
274 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  38.1 
 
 
290 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  33.92 
 
 
307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  38.63 
 
 
273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  35.46 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  33.92 
 
 
295 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  38.11 
 
 
320 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  35.47 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  33.45 
 
 
327 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  33.8 
 
 
312 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  36.5 
 
 
308 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  32.04 
 
 
312 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  32.63 
 
 
302 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
293 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  32.01 
 
 
304 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  33.1 
 
 
305 aa  159  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  34.72 
 
 
271 aa  158  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  35.09 
 
 
271 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
293 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
293 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
313 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  32.37 
 
 
302 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  31.93 
 
 
302 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  35.31 
 
 
325 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  33.69 
 
 
290 aa  155  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  31.6 
 
 
304 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  32.49 
 
 
323 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  34.57 
 
 
274 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  32.04 
 
 
304 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  36.4 
 
 
280 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  31.6 
 
 
314 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  32.01 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  34.55 
 
 
315 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  33.69 
 
 
285 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  30.63 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  40.76 
 
 
198 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  40.76 
 
 
198 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  37.41 
 
 
290 aa  135  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  32.25 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  29.97 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  31.07 
 
 
296 aa  125  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  30.55 
 
 
287 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  31.09 
 
 
306 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  31.09 
 
 
306 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  30.08 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  30.86 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  31.14 
 
 
308 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  32.01 
 
 
368 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  32.01 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  32.01 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  32.01 
 
 
330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  32.01 
 
 
330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  32.01 
 
 
330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  32.01 
 
 
330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  31.97 
 
 
302 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  30.58 
 
 
280 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  32.34 
 
 
277 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  32.59 
 
 
298 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  29.56 
 
 
271 aa  105  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  32.22 
 
 
296 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  30.14 
 
 
280 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  28.04 
 
 
301 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>