More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0829 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 362 aa  727    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4766  porin  34.29 
 
 		 390 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3601  porin  34.29 
 
 		 390 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5517  porin  34.29 
 
 		 390 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5897  outer membrane protein (porin)-like protein  34.37 
 
 		 390 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0466663 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  34.28 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  32.7 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0949  outer membrane protein (porin)-like  34.6 
 
 		 390 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  33.65 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  33.65 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  33.65 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  32.59 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  35.58 
 
 		 389 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  35.58 
 
 		 389 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  35.58 
 
 		 389 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1963  porin  32.41 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.513284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  31.42 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  29.51 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  32.73 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  33.85 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  32.73 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  31.2 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  31.04 
 
 		 348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  32 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  34.52 
 
 		 344 aa  113  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  31.81 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1437  outer membrane porin  30.23 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2592  outer membrane porin protein  30.23 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1412  porin  30.58 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170387  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  33.23 
 
 		 496 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1352  outer membrane porin  30.23 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0561388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  30.7 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  32.02 
 
 		 351 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  30.41 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2734  outer membrane protein (porin)  34.14 
 
 		 362 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00626959  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  32.24 
 
 		 351 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6530  outer membrane protein, (porin)-like  31.87 
 
 		 417 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0213  putative outer membrane porin  30.05 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1242  putative outer membrane porin  30.05 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  35.56 
 
 		 375 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  30.57 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0486  putative outer membrane porin  30.05 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  35.56 
 
 		 375 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1086  putative outer membrane porin  30.05 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  30.81 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  32.57 
 
 		 352 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  32.57 
 
 		 352 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  31.14 
 
 		 399 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  31.14 
 
 		 399 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  29.77 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0155  porin  31.25 
 
 		 370 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  31.14 
 
 		 399 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  31.14 
 
 		 399 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3435  porin  32.15 
 
 		 362 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  32.7 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  32.7 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  32.7 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  32.7 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  32.7 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  33.24 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  33.91 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4082  porin  31.88 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1303  outer membrane porin  32.7 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  30.81 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  32.7 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  30.18 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  30.83 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  33.43 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  34.5 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  30.28 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  33.76 
 
 		 387 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  33.76 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  30.9 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  33.13 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  33.44 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  31.51 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  31.15 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  31.99 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  29.9 
 
 		 383 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  30.25 
 
 		 356 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  33.91 
 
 		 394 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  30.69 
 
 		 356 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  30.69 
 
 		 356 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  34.4 
 
 		 386 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  32.2 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  30.81 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  29.9 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  38.5 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5627  porin  31.71 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0464814  normal  0.0831491 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  30.18 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  32.43 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  30.52 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  33.44 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  32.43 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  37.82 
 
 		 523 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  30.79 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  37.31 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  36.45 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  30.25 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  28.07 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>