More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0797 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  329  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  30.08 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.77 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.77 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.77 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.77 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.77 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  24.63 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.41 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  31.33 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  30.48 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  28.57 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  25.66 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  28.47 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  30.43 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  35.45 
 
 		 214 aa  51.2  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>