166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1889 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  30.81 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  33.9 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  30.69 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  34.43 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  33.61 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  32.8 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  34.18 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  34.18 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  32.16 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  31.78 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  30.9 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  29.27 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  31.49 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  31.84 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  27.95 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  28.74 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  32.27 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  28.9 
 
 		 270 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  29.15 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  29.83 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  28.63 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  29.83 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  28.24 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  32.02 
 
 		 278 aa  92.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  36.47 
 
 		 291 aa  92.8  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  32.64 
 
 		 251 aa  91.7  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  31.85 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  27.82 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  28.21 
 
 		 273 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  29.24 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  30 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  28.63 
 
 		 275 aa  88.6  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  29.12 
 
 		 277 aa  87.8  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  36.09 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  26.98 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  36.69 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  30.94 
 
 		 255 aa  85.5  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  35.5 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  30.16 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  31.8 
 
 		 286 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  25.51 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  27.98 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  28.19 
 
 		 590 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  30.67 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  32.62 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  34.66 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  33.54 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  25.57 
 
 		 599 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  29.19 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  26.09 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  30.48 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  30 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  26.46 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  25.49 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  25.85 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  25.51 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1076  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25.85 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  30.54 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.78 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  27.41 
 
 		 505 aa  53.9  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  24.1 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.6 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  27.95 
 
 		 448 aa  52.4  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25 
 
 		 213 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  31.45 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2491  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.51 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000498099 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.8 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  26.95 
 
 		 217 aa  52  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5268  putative CoA transferase beta subunit  29.7 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  29.53 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1619  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.31 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05669  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase (ScoT), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12250)  27.04 
 
 		 519 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2278  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.73 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2576  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.13 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3054  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.91 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  26.62 
 
 		 209 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2252  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  27.41 
 
 		 218 aa  48.9  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  31.61 
 
 		 249 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  31.61 
 
 		 249 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  31.61 
 
 		 249 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  23.78 
 
 		 213 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  26.67 
 
 		 209 aa  48.5  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  28.89 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1891  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  29.41 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2328  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.41 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.208746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2979  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.41 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2400  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.41 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.724461  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1666  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.41 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2834  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.41 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1524  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.41 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1713  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.41 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2852  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.41 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.69 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2733  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.94 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1135  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  23.76 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.15 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  24.86 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25.15 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.15 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>