119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1336 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  100 
 
 		 106 aa  219  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  85.85 
 
 		 106 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  71.43 
 
 		 107 aa  165  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  64.49 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  64.49 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  63.55 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  64.49 
 
 		 108 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  63.55 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  64.49 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  64.49 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  65.42 
 
 		 108 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  63.55 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  63.55 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  61.68 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  61.9 
 
 		 108 aa  141  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  62.14 
 
 		 108 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  59.43 
 
 		 109 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  57.55 
 
 		 107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  61.17 
 
 		 108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  57.55 
 
 		 110 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  53.77 
 
 		 117 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  53 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  50 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  51.49 
 
 		 109 aa  117  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  56.84 
 
 		 111 aa  117  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  56.84 
 
 		 111 aa  117  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  54.64 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  53.54 
 
 		 111 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  54.44 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  47.47 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  45.71 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  48.11 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  50.56 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  32.47 
 
 		 768 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  30.43 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  35 
 
 		 406 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  23.53 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  32.93 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  25.27 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  26.74 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  31.08 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  27.71 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  27.18 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  34.78 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  32.79 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  37.93 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  30.51 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  31.75 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  32.35 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  26.21 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  27.38 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  26.21 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  32.97 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  32.97 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  32.97 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  40.28 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  30.3 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  30.43 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4142  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.5 
 
 		 581 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  27.88 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  32.88 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  35.23 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  29.33 
 
 		 122 aa  42.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  35.71 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  29.87 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  28.57 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  35.71 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  35.71 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  31.82 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  31.11 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  27.5 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  30.3 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  27.69 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  35.71 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  38.24 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  37.68 
 
 		 149 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  38.24 
 
 		 146 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  27.69 
 
 		 124 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  27.69 
 
 		 124 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  28.79 
 
 		 124 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9748  predicted protein  31.82 
 
 		 108 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.82657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  28.79 
 
 		 149 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  30 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  26.74 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  29.58 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  25.32 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  28.12 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  27.69 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  36.23 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  30.12 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  26.21 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  26.21 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  26.21 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  26.21 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  33.82 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  26.21 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  26.21 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  26.21 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>