261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3752 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3752  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 772 aa  1587    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2955  prophage MuMc02, transposase protein A, putative  40.61 
 
 		 709 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.456308  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  29.4 
 
 		 738 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  29.65 
 
 		 738 aa  313  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  33.38 
 
 		 718 aa  296  8e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  28.32 
 
 		 724 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0643  transposase, putative  30.99 
 
 		 715 aa  240  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0270  bacteriophage DNA transposition protein A, putative  26.65 
 
 		 690 aa  101  6e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.513793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3350  bacteriophage transposase A protein, putative  22.7 
 
 		 708 aa  84.3  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0252  putative bacteriophage DNA transposition protein A  35.61 
 
 		 372 aa  84  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  22.58 
 
 		 468 aa  79.7  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  30.92 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  25.65 
 
 		 663 aa  75.5  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  23.21 
 
 		 497 aa  72.4  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  23.21 
 
 		 497 aa  72.4  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  23.21 
 
 		 497 aa  72.4  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  25.18 
 
 		 558 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  22.8 
 
 		 561 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  34.57 
 
 		 547 aa  70.5  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  25.18 
 
 		 558 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  23.04 
 
 		 480 aa  70.5  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  23.04 
 
 		 480 aa  70.5  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  21.11 
 
 		 481 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  21.11 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  23.68 
 
 		 567 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  24.88 
 
 		 649 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  27 
 
 		 810 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  25.24 
 
 		 555 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3035  transposase protein  23.97 
 
 		 690 aa  62  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277466  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  23.64 
 
 		 651 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  21.72 
 
 		 618 aa  61.2  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4367  hypothetical protein  45.9 
 
 		 216 aa  60.1  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  0.0748532 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  23.63 
 
 		 536 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  26.37 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  23.3 
 
 		 617 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  24.5 
 
 		 665 aa  58.5  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  24.3 
 
 		 626 aa  58.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1049  bacteriophage Mu transposase MuA  42.37 
 
 		 662 aa  58.2  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  27.72 
 
 		 670 aa  57.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  23.51 
 
 		 677 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  23.51 
 
 		 652 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  25.26 
 
 		 791 aa  57.4  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  22.62 
 
 		 630 aa  57.4  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 652 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  23.51 
 
 		 652 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1050  putative repressor protein  42.19 
 
 		 174 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.678331  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1628  ISRSO16-transposase ORFB protein  32.2 
 
 		 269 aa  56.2  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  25.93 
 
 		 548 aa  56.6  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  22.33 
 
 		 644 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  22.78 
 
 		 617 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  24.54 
 
 		 459 aa  55.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1010  integrase catalytic subunit  24.54 
 
 		 459 aa  55.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  24.54 
 
 		 459 aa  55.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  24.54 
 
 		 459 aa  55.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  46.88 
 
 		 671 aa  55.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 269 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  22.75 
 
 		 416 aa  54.7  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  23.4 
 
 		 653 aa  54.7  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2907  integrase catalytic subunit  26.91 
 
 		 736 aa  54.7  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341428  normal  0.384956 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  32.2 
 
 		 280 aa  54.3  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  21.47 
 
 		 417 aa  53.9  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  26.14 
 
 		 595 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  21.47 
 
 		 417 aa  53.9  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  22.96 
 
 		 417 aa  53.9  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  27.54 
 
 		 749 aa  52.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  34.78 
 
 		 269 aa  52.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  28 
 
 		 560 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  34.94 
 
 		 662 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  34.78 
 
 		 269 aa  53.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  34.86 
 
 		 280 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  34.78 
 
 		 269 aa  53.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  34.94 
 
 		 662 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1105  integrase catalytic subunit  29.45 
 
 		 426 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0473204  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3239  integrase catalytic subunit  24.54 
 
 		 330 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  33.94 
 
 		 312 aa  53.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2509  integrase  34.78 
 
 		 231 aa  53.5  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0263754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  34.78 
 
 		 269 aa  52.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  39.19 
 
 		 341 aa  52.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  33.94 
 
 		 290 aa  52.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1264  Transposase-like Mu  23.09 
 
 		 728 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000119608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  33.94 
 
 		 290 aa  52.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  37.33 
 
 		 575 aa  52.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  21.8 
 
 		 625 aa  52  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  32.08 
 
 		 280 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  30.7 
 
 		 284 aa  52  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  38.39 
 
 		 284 aa  52.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  30.91 
 
 		 240 aa  52  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  30.91 
 
 		 240 aa  52  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  30.91 
 
 		 240 aa  52  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7700  IS3 family transposase  29.58 
 
 		 359 aa  51.6  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4005  Integrase catalytic region  30.56 
 
 		 281 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795108  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  38.39 
 
 		 260 aa  51.6  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  31.48 
 
 		 174 aa  51.6  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  31.48 
 
 		 174 aa  51.6  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  34.86 
 
 		 290 aa  51.2  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  34.86 
 
 		 290 aa  51.2  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5252  integrase catalytic region  32.73 
 
 		 577 aa  51.2  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5024  integrase catalytic region  32.73 
 
 		 577 aa  51.2  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3389  integrase catalytic subunit  23.9 
 
 		 689 aa  50.8  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  23.14 
 
 		 697 aa  50.8  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>