More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2849 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  691    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  56.25 
 
 		 326 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  54.86 
 
 		 318 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  53.12 
 
 		 324 aa  292  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  53.12 
 
 		 324 aa  292  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  53.12 
 
 		 324 aa  292  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  50.58 
 
 		 322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  50.39 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  47.33 
 
 		 350 aa  272  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  42.02 
 
 		 331 aa  208  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  37.7 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0620  hypothetical protein  38.08 
 
 		 322 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  35.04 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  34.47 
 
 		 322 aa  146  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  35.2 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  33.58 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  35.38 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  32.7 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  31.03 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  34.23 
 
 		 333 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  31.03 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  30.5 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  35.27 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  29.89 
 
 		 325 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  30.8 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0712  hypothetical protein  33.85 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.780507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  32.47 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  31.56 
 
 		 335 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  31.96 
 
 		 327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  38.79 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5507  hypothetical protein  36.2 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  34.36 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  32.03 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  35.56 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  33.99 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0906  hypothetical protein  36.58 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  30.71 
 
 		 325 aa  133  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  33.77 
 
 		 332 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  31.37 
 
 		 326 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  37.38 
 
 		 332 aa  133  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5765  hypothetical protein  35.59 
 
 		 326 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  34.12 
 
 		 325 aa  132  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  33.6 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  32.57 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  37.44 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  30.26 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  32.18 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  35.37 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  30.92 
 
 		 318 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  36.05 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  34.77 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  38.57 
 
 		 331 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  32.24 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  34.25 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  34.36 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  26.77 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  30.77 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  37.38 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  33.72 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  31.15 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  33.71 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  37.38 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3213  hypothetical protein  31.76 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  36.28 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.89 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  31.32 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  35.84 
 
 		 338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0277  hypothetical protein  34.2 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0610  hypothetical protein  34.72 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417146  normal  0.0239615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  35.87 
 
 		 326 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3055  hypothetical protein  33.46 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150263  normal  0.0186232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  31.32 
 
 		 323 aa  126  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4101  extra-cytoplasmic solute receptor  36.1 
 
 		 328 aa  126  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0889008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  30.94 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  31.37 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  34.24 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  29.55 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3410  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  33.07 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.523204  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  34.11 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  37.44 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  32.7 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  35.75 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  34.6 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  33.49 
 
 		 344 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  30.92 
 
 		 331 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  32.28 
 
 		 326 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  37.14 
 
 		 335 aa  122  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0596  hypothetical protein  34.08 
 
 		 346 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.096367  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  32.74 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1257  hypothetical protein  35.6 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  31.95 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  32.81 
 
 		 322 aa  122  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  31.56 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0880  hypothetical protein  35.29 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  33.98 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  35.63 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  28.63 
 
 		 339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  35.25 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>