More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3213 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3213  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308307  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3211  hypothetical protein  56.42 
 
 
328 aa  309  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119148  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  42.47 
 
 
353 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  41.95 
 
 
355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  41.69 
 
 
322 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  41.53 
 
 
334 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.81 
 
 
326 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  41.88 
 
 
324 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  41.78 
 
 
326 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  40.48 
 
 
339 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.3 
 
 
318 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  40.68 
 
 
322 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  39.8 
 
 
323 aa  225  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.39 
 
 
358 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.13 
 
 
339 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.74 
 
 
328 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.58 
 
 
339 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  39.5 
 
 
320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  36.75 
 
 
337 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  38.13 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  36.81 
 
 
324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  39.29 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.35 
 
 
323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.93 
 
 
327 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  38.8 
 
 
322 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37.18 
 
 
321 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  36.53 
 
 
333 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37.5 
 
 
325 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  37.3 
 
 
343 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  36.91 
 
 
326 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  39.38 
 
 
698 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  38.26 
 
 
325 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  36.17 
 
 
344 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.6 
 
 
332 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  38.46 
 
 
325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  39.53 
 
 
329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  39.87 
 
 
318 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  39.93 
 
 
323 aa  215  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  38.83 
 
 
330 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  36.61 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  36.19 
 
 
330 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  37.92 
 
 
327 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  42.19 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  36.61 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  39.34 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  36.31 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  38.23 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.36 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  39.02 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  39.1 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  40.33 
 
 
337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  39.13 
 
 
333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  39.14 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  36.79 
 
 
339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  36.39 
 
 
310 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  35.89 
 
 
330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  40.58 
 
 
332 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  35.29 
 
 
329 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.36 
 
 
325 aa  212  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  38.19 
 
 
338 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  38.91 
 
 
331 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  37.67 
 
 
339 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.66 
 
 
328 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  38.59 
 
 
326 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  38.8 
 
 
321 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  38.13 
 
 
338 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  37.74 
 
 
347 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  37.7 
 
 
325 aa  209  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  38.1 
 
 
334 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  38.36 
 
 
334 aa  208  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  38.49 
 
 
361 aa  208  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  36.94 
 
 
322 aa  209  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  36 
 
 
332 aa  208  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  35.67 
 
 
325 aa  208  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.14 
 
 
331 aa  208  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  37.21 
 
 
334 aa  208  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  37.92 
 
 
325 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  37.46 
 
 
320 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  37.75 
 
 
331 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  36.23 
 
 
330 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  38.51 
 
 
339 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  37.92 
 
 
353 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  37.92 
 
 
327 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  36.61 
 
 
326 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  40.32 
 
 
341 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  40.07 
 
 
328 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  35.76 
 
 
327 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  42 
 
 
327 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.86 
 
 
335 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  35.76 
 
 
322 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  36.59 
 
 
331 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2118  hypothetical protein  38.67 
 
 
331 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0299117  normal  0.0185863 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  40.27 
 
 
326 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  39.36 
 
 
318 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  35.69 
 
 
327 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  35.62 
 
 
318 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  38.69 
 
 
360 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  36.39 
 
 
320 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  36.7 
 
 
325 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  36.5 
 
 
335 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>