More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3211 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3211  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119148  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3213  hypothetical protein  56.77 
 
 
327 aa  316  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308307  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  42.41 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.05 
 
 
331 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  43.86 
 
 
321 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.49 
 
 
328 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.84 
 
 
339 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  41.61 
 
 
323 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  42.99 
 
 
332 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  43.01 
 
 
339 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  42.03 
 
 
355 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.61 
 
 
353 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  41.46 
 
 
312 aa  222  8e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.63 
 
 
327 aa  221  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  40.78 
 
 
334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.48 
 
 
322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  38.71 
 
 
325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  38.75 
 
 
325 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  38.06 
 
 
339 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  37.11 
 
 
349 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  37.74 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  42.86 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  44.52 
 
 
332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  35.31 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  37.42 
 
 
333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  42.14 
 
 
338 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.93 
 
 
337 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  42.14 
 
 
333 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  39.24 
 
 
322 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.89 
 
 
330 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  37.87 
 
 
322 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  39.04 
 
 
339 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  40.91 
 
 
332 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  41.52 
 
 
323 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  40.51 
 
 
318 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  36.53 
 
 
326 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  38.69 
 
 
334 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  39.33 
 
 
330 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  38.08 
 
 
344 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  36.33 
 
 
334 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  39.2 
 
 
336 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  41.35 
 
 
337 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  39.76 
 
 
331 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  39.49 
 
 
327 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  38.71 
 
 
332 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  42.31 
 
 
326 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  39.86 
 
 
320 aa  205  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  41.7 
 
 
318 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  40.96 
 
 
325 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  40.24 
 
 
386 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  33.44 
 
 
327 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  38.31 
 
 
333 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.91 
 
 
327 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.2 
 
 
326 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  39.31 
 
 
330 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  37.42 
 
 
330 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.03 
 
 
323 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  39.42 
 
 
324 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  37.26 
 
 
326 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  37.22 
 
 
327 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.07 
 
 
333 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  38.23 
 
 
327 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  39.05 
 
 
347 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  36.3 
 
 
326 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  38.49 
 
 
326 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.8 
 
 
325 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  37.88 
 
 
334 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  39.06 
 
 
325 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  39.93 
 
 
339 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  37.18 
 
 
335 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  37.79 
 
 
338 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  39.7 
 
 
310 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  36.59 
 
 
325 aa  202  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  39.37 
 
 
698 aa  202  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  37.91 
 
 
320 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  38.19 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  36.54 
 
 
332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2931  hypothetical protein  42.31 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  39.31 
 
 
330 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  35.81 
 
 
329 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  39.58 
 
 
332 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  37.61 
 
 
339 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.97 
 
 
358 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  37.11 
 
 
326 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  35.02 
 
 
336 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  42.97 
 
 
335 aa  199  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0712  hypothetical protein  41.31 
 
 
324 aa  199  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.780507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  42.53 
 
 
323 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.01 
 
 
332 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  40.49 
 
 
342 aa  198  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.64 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.68 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  42.29 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  35.57 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.68 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  38.28 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  35.66 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  38.16 
 
 
345 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  35.83 
 
 
331 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  38.32 
 
 
329 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>