117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1713 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  100 
 
 		 452 aa  935    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  81.98 
 
 		 446 aa  771    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  88.29 
 
 		 453 aa  801    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  81.31 
 
 		 446 aa  764    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  58.2 
 
 		 454 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  55.63 
 
 		 445 aa  522  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  55.41 
 
 		 446 aa  523  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  55.48 
 
 		 458 aa  518  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  53.98 
 
 		 453 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  55.73 
 
 		 452 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  54.48 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  54.24 
 
 		 455 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  51.33 
 
 		 452 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  55.13 
 
 		 447 aa  474  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  52.81 
 
 		 451 aa  473  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  50.22 
 
 		 452 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  53.93 
 
 		 435 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  48.65 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  34.15 
 
 		 443 aa  226  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  32.21 
 
 		 438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  32.21 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  32.21 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  32.22 
 
 		 439 aa  213  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  30.49 
 
 		 439 aa  211  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  31.4 
 
 		 441 aa  204  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  30.31 
 
 		 430 aa  201  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  27.23 
 
 		 430 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  32.6 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  31.82 
 
 		 449 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.47 
 
 		 437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  29.78 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  30.22 
 
 		 453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  30.27 
 
 		 437 aa  156  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  30.04 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  29.6 
 
 		 429 aa  147  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  30.58 
 
 		 428 aa  146  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  27.72 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  27.66 
 
 		 418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  28.71 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  27.44 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  28.85 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  29.52 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  27.48 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  24.35 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  21.88 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  26.47 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  30.95 
 
 		 442 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  30.95 
 
 		 442 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  32.14 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  31.43 
 
 		 442 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  26.86 
 
 		 436 aa  53.5  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  28.78 
 
 		 443 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  30.06 
 
 		 434 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  30 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  30 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  29.76 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  29.76 
 
 		 434 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  27.98 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  26.29 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  28.17 
 
 		 453 aa  50.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  27.55 
 
 		 440 aa  50.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2035  Homoserine dehydrogenase  33.88 
 
 		 452 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  35.58 
 
 		 436 aa  50.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  29.29 
 
 		 433 aa  50.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  28.9 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  32.06 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  33.1 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  25.85 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  28.17 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  25.34 
 
 		 449 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  26.53 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  29.93 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  26.29 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.55 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  34.55 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  34.55 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  28 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  33.1 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  30.94 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  30.37 
 
 		 448 aa  48.5  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  28.78 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  26.29 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  28.03 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  30.58 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  26.9 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  28.78 
 
 		 442 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  27.21 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  26.9 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  26.9 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  26.9 
 
 		 434 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  29.32 
 
 		 431 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  30.37 
 
 		 469 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  38.57 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  32.19 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  27.54 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2454  homoserine dehydrogenase  37.84 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  29.41 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  26.19 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>