47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2334 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  100 
 
 		 456 aa  885    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  53.2 
 
 		 455 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  55.48 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  42.86 
 
 		 467 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  35.78 
 
 		 434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  31.89 
 
 		 452 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  32.56 
 
 		 458 aa  152  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  35.56 
 
 		 435 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  31.44 
 
 		 452 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  29.59 
 
 		 450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  32.88 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  32.73 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  30.27 
 
 		 430 aa  143  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  33.18 
 
 		 454 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  30.47 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  31.71 
 
 		 453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  29.84 
 
 		 438 aa  132  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  29.84 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  34.26 
 
 		 455 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  29.58 
 
 		 438 aa  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  30.54 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  33.03 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  30.25 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  30.93 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  30.47 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  30.11 
 
 		 446 aa  117  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  29.95 
 
 		 446 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  29.53 
 
 		 452 aa  113  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  29.36 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 453 aa  106  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  26.56 
 
 		 430 aa  106  9e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  27.14 
 
 		 424 aa  95.9  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  28.51 
 
 		 453 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  24.62 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  29.17 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  26.89 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  27.37 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  25.52 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  25.82 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  28.95 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  27.79 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  26.61 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  26.05 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  35 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  36.07 
 
 		 441 aa  43.9  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  23.23 
 
 		 377 aa  43.1  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>