43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2407 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  100 
 
 		 377 aa  775    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  58.71 
 
 		 396 aa  463  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  30.56 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  30.32 
 
 		 449 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  31.48 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  30.47 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  28.99 
 
 		 437 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.66 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  28.4 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  30.47 
 
 		 429 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  30.34 
 
 		 441 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  30.81 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  30.99 
 
 		 418 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  28.05 
 
 		 439 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  30.82 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  29.3 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  28.39 
 
 		 438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  28.13 
 
 		 438 aa  120  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  28.13 
 
 		 438 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  26.55 
 
 		 439 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  27.09 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  26.71 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  25.3 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  29.18 
 
 		 430 aa  83.2  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  25.36 
 
 		 446 aa  82.8  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  24.35 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  28.74 
 
 		 452 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  28.49 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  25.53 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  25.88 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  25.18 
 
 		 453 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  26.29 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  25.3 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  23.99 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  25.44 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  26.89 
 
 		 454 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  25.72 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  22.54 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  22.9 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  24.59 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  28.38 
 
 		 440 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>